28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8966 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8966  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  523  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0337189  normal  0.659261 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4856  transcriptional regulator, XRE family  47.37 
 
 		 247 aa  229  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8697  hypothetical protein  45.45 
 
 		 246 aa  217  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8671  hypothetical protein  45.45 
 
 		 246 aa  217  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4862  hypothetical protein  42.44 
 
 		 243 aa  199  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8677  hypothetical protein  43.95 
 
 		 244 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3120  hypothetical protein  41.53 
 
 		 249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.521151 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1136  XRE family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 282 aa  162  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5332  XRE family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 392 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0132  hypothetical protein  42.51 
 
 		 180 aa  159  4e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3169  hypothetical protein  35.48 
 
 		 266 aa  148  7e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3231  helix-turn-helix domain-containing protein  35.48 
 
 		 266 aa  148  7e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346295  normal  0.68449 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3181  helix-turn-helix domain-containing protein  35.48 
 
 		 266 aa  148  7e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7030  hypothetical protein  31.91 
 
 		 260 aa  148  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.292023 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3032  helix-turn-helix domain-containing protein  35.48 
 
 		 272 aa  143  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1522  hypothetical protein  46.58 
 
 		 193 aa  142  7e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5995  XRE family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 182 aa  122  8e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113764 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5594  XRE family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 182 aa  122  8e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7026  hypothetical protein  28.27 
 
 		 201 aa  102  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1898  hypothetical protein  44.62 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.414161  normal  0.243648 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1433  hypothetical protein  50 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.669776  hitchhiker  0.000487487 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3658  hypothetical protein  49.18 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.877155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0098  hypothetical protein  45.9 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0255741  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0102  hypothetical protein  45.9 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3010  hypothetical protein  45.45 
 
 		 169 aa  53.5  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1415  hypothetical protein  41.18 
 
 		 255 aa  53.1  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0574374 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1378  hypothetical protein  41.18 
 
 		 255 aa  52.8  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.508501  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30300  hypothetical protein  24.18 
 
 		 296 aa  45.8  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.92988  normal  0.817284 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>