20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5995 on replicon NC_008704
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008147  Mmcs_5594  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 182 aa  367  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5995  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 182 aa  367  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113764 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3169  hypothetical protein  95.6 
 
 		 266 aa  353  7.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3231  helix-turn-helix domain-containing protein  95.6 
 
 		 266 aa  353  7.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346295  normal  0.68449 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3181  helix-turn-helix domain-containing protein  95.6 
 
 		 266 aa  353  7.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3032  helix-turn-helix domain-containing protein  92.31 
 
 		 272 aa  340  5.999999999999999e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5332  XRE family transcriptional regulator  40.25 
 
 		 392 aa  123  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1136  XRE family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 282 aa  122  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113401  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1522  hypothetical protein  39.88 
 
 		 193 aa  122  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8966  hypothetical protein  36.93 
 
 		 256 aa  122  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0337189  normal  0.659261 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4862  hypothetical protein  39.87 
 
 		 243 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3120  hypothetical protein  37.21 
 
 		 249 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.521151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8677  hypothetical protein  38.79 
 
 		 244 aa  113  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4856  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 247 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0132  hypothetical protein  33.33 
 
 		 180 aa  107  8.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8671  hypothetical protein  34.83 
 
 		 246 aa  105  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8697  hypothetical protein  34.83 
 
 		 246 aa  105  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7030  hypothetical protein  26.63 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.292023 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7026  hypothetical protein  26.04 
 
 		 201 aa  74.7  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0893  hypothetical protein  25.2 
 
 		 292 aa  42  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>