23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7030 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7030  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  540  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.292023 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7026  hypothetical protein  91.54 
 
 		 201 aa  391  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8966  hypothetical protein  31.91 
 
 		 256 aa  148  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0337189  normal  0.659261 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4856  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 247 aa  143  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3120  hypothetical protein  33.61 
 
 		 249 aa  139  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.521151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8697  hypothetical protein  31.3 
 
 		 246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8671  hypothetical protein  31.3 
 
 		 246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8677  hypothetical protein  36.16 
 
 		 244 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4862  hypothetical protein  31.38 
 
 		 243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1136  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5332  XRE family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 392 aa  116  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0132  hypothetical protein  30.54 
 
 		 180 aa  99  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3181  helix-turn-helix domain-containing protein  27.94 
 
 		 266 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3231  helix-turn-helix domain-containing protein  27.94 
 
 		 266 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346295  normal  0.68449 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3169  hypothetical protein  27.94 
 
 		 266 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3032  helix-turn-helix domain-containing protein  28 
 
 		 272 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5995  XRE family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 182 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113764 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5594  XRE family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 182 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1522  hypothetical protein  23.84 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0098  hypothetical protein  49.23 
 
 		 255 aa  57  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0255741  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0102  hypothetical protein  42.22 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1898  hypothetical protein  42.37 
 
 		 252 aa  44.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.414161  normal  0.243648 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3658  hypothetical protein  37.29 
 
 		 245 aa  42.7  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.877155  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>