20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3032 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3032  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 
272 aa  556  1e-157  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3169  hypothetical protein  84.27 
 
 
266 aa  455  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3231  helix-turn-helix domain-containing protein  84.27 
 
 
266 aa  455  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346295  normal  0.68449 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3181  helix-turn-helix domain-containing protein  84.27 
 
 
266 aa  455  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5594  XRE family transcriptional regulator  92.31 
 
 
182 aa  340  1e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5995  XRE family transcriptional regulator  92.31 
 
 
182 aa  340  1e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113764 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8966  hypothetical protein  35.48 
 
 
256 aa  143  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0337189  normal  0.659261 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3120  hypothetical protein  35.22 
 
 
249 aa  136  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.521151 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4862  hypothetical protein  36.4 
 
 
243 aa  135  8e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8697  hypothetical protein  34.25 
 
 
246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4856  transcriptional regulator, XRE family  33.07 
 
 
247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8671  hypothetical protein  34.25 
 
 
246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5332  XRE family transcriptional regulator  42.14 
 
 
392 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8677  hypothetical protein  36.55 
 
 
244 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1136  XRE family transcriptional regulator  41.51 
 
 
282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113401  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1522  hypothetical protein  38.59 
 
 
193 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0132  hypothetical protein  31.58 
 
 
180 aa  100  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7030  hypothetical protein  28 
 
 
260 aa  93.6  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.292023 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7026  hypothetical protein  25.51 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0893  hypothetical protein  28.46 
 
 
292 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>