28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8697 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8697  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  502  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8671  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  502  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4856  transcriptional regulator, XRE family  67.21 
 
 		 247 aa  353  1e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4862  hypothetical protein  52.72 
 
 		 243 aa  255  6e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8677  hypothetical protein  52.07 
 
 		 244 aa  250  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1522  hypothetical protein  65.85 
 
 		 193 aa  228  5e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8966  hypothetical protein  45.45 
 
 		 256 aa  217  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0337189  normal  0.659261 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3120  hypothetical protein  45.15 
 
 		 249 aa  199  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.521151 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1136  XRE family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 282 aa  154  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5332  XRE family transcriptional regulator  47.31 
 
 		 392 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0132  hypothetical protein  43.27 
 
 		 180 aa  148  9e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7030  hypothetical protein  31.3 
 
 		 260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.292023 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3032  helix-turn-helix domain-containing protein  34.25 
 
 		 272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3169  hypothetical protein  34.4 
 
 		 266 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3231  helix-turn-helix domain-containing protein  34.4 
 
 		 266 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346295  normal  0.68449 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3181  helix-turn-helix domain-containing protein  34.4 
 
 		 266 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5594  XRE family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 182 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5995  XRE family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 182 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113764 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7026  hypothetical protein  26.92 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1898  hypothetical protein  49.28 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.414161  normal  0.243648 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0102  hypothetical protein  49.18 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0098  hypothetical protein  49.18 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0255741  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1415  hypothetical protein  42.03 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0574374 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1378  hypothetical protein  42.86 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.508501  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3658  hypothetical protein  46.77 
 
 		 245 aa  52  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.877155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3010  hypothetical protein  40.98 
 
 		 169 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1433  hypothetical protein  45.9 
 
 		 254 aa  50.1  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.669776  hitchhiker  0.000487487 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5254  hypothetical protein  27.48 
 
 		 394 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.580561  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>