19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7026 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7026  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  418  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7030  hypothetical protein  91.54 
 
 		 260 aa  391  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.292023 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1136  XRE family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 282 aa  113  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5332  XRE family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 392 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3120  hypothetical protein  31.15 
 
 		 249 aa  106  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.521151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8966  hypothetical protein  28.27 
 
 		 256 aa  102  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0337189  normal  0.659261 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0132  hypothetical protein  30.54 
 
 		 180 aa  97.8  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4862  hypothetical protein  29.34 
 
 		 243 aa  93.6  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4856  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 247 aa  92.8  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8677  hypothetical protein  32.53 
 
 		 244 aa  87.8  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8671  hypothetical protein  26.92 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8697  hypothetical protein  26.92 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5995  XRE family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 182 aa  74.7  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113764 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5594  XRE family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 182 aa  74.7  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3032  helix-turn-helix domain-containing protein  25.51 
 
 		 272 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3181  helix-turn-helix domain-containing protein  26.18 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3231  helix-turn-helix domain-containing protein  26.18 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346295  normal  0.68449 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3169  hypothetical protein  26.18 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1522  hypothetical protein  22.67 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>