23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1669 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_1656    99.76 
 
 		 1263 bp  2480    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0164241  hitchhiker  0.00341593 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1669    100 
 
 		 1263 bp  2504    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184902  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0979  site-specific recombinase, phage integrase family protein  93.75 
 
 		 1263 bp  1877    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000444866  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2174    80.93 
 
 		 1256 bp  436  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00617567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2126    80.39 
 
 		 1256 bp  396  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00875728  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1514  integrase family protein  81.75 
 
 		 1272 bp  270  8.999999999999999e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3034  integrase family protein  82.2 
 
 		 1260 bp  151  6e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3419  integrase family protein  80.68 
 
 		 1260 bp  133  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.837092  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3537  integrase family protein  79.43 
 
 		 1260 bp  123  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1693  integrase family protein  77.78 
 
 		 1272 bp  111  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0501  integrase family protein  79.66 
 
 		 1260 bp  109  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1465    89.58 
 
 		 813 bp  103  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000159039  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0858  integrase family protein  85.84 
 
 		 1260 bp  97.6  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1588    80.38 
 
 		 1184 bp  89.7  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2104  phage integrase family site specific recombinase  86.52 
 
 		 1263 bp  81.8  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000885987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0447  integrase family protein  85.19 
 
 		 1260 bp  65.9  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1510    83.33 
 
 		 264 bp  63.9  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0809  phage integrase family site specific recombinase  92.68 
 
 		 1260 bp  58  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1561  integrase family protein  83.78 
 
 		 156 bp  52  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.744985  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3702  integrase family protein  96.55 
 
 		 1257 bp  50.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0871  integrase family protein  93.75 
 
 		 1260 bp  48.1  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2305  integrase  93.75 
 
 		 1275 bp  48.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000673705  hitchhiker  1.06104e-16 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2068  integrase  93.75 
 
 		 1275 bp  48.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000306631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>