19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1465 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1465    100 
 
 		 813 bp  1612    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000159039  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1588    88.3 
 
 		 1184 bp  371  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1693  integrase family protein  86.6 
 
 		 1272 bp  363  5e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1514  integrase family protein  90.12 
 
 		 1272 bp  291  2e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1561  integrase family protein  92.13 
 
 		 156 bp  121  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.744985  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1478    92.77 
 
 		 474 bp  117  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0979  site-specific recombinase, phage integrase family protein  85.06 
 
 		 1263 bp  115  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000444866  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1656    90.62 
 
 		 1263 bp  111  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0164241  hitchhiker  0.00341593 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1669    89.58 
 
 		 1263 bp  103  8e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184902  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1259    91.25 
 
 		 132 bp  103  8e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.540765  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1510    86.67 
 
 		 264 bp  83.8  0.00000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2126    85.87 
 
 		 1256 bp  71.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00875728  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2174    84.78 
 
 		 1256 bp  63.9  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00617567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0447  integrase family protein  86.15 
 
 		 1260 bp  58  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2104  phage integrase family site specific recombinase  81.73 
 
 		 1263 bp  56  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000885987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2465    88 
 
 		 96 bp  52  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3419  integrase family protein  93.94 
 
 		 1260 bp  50.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.837092  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0858  integrase family protein  84.62 
 
 		 1260 bp  50.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4051  phage integrase family site specific recombinase  83.82 
 
 		 1260 bp  48.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102635  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>