28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1588 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1693  integrase family protein  89.91 
 
 		 1272 bp  973    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1588    100 
 
 		 1184 bp  2347    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1514  integrase family protein  86.03 
 
 		 1272 bp  720    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1465    88.3 
 
 		 813 bp  371  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000159039  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1561  integrase family protein  90 
 
 		 156 bp  167  9e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.744985  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2104  phage integrase family site specific recombinase  81.75 
 
 		 1263 bp  147  8e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000885987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1478    81.31 
 
 		 474 bp  109  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1259    93.85 
 
 		 132 bp  97.6  7e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.540765  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1656    90 
 
 		 1263 bp  95.6  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0164241  hitchhiker  0.00341593 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0979  site-specific recombinase, phage integrase family protein  89.87 
 
 		 1263 bp  93.7  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000444866  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1669    80.38 
 
 		 1263 bp  89.7  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184902  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3878  integrase family protein  88.31 
 
 		 1266 bp  81.8  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1510    86 
 
 		 264 bp  79.8  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2174    82.01 
 
 		 1256 bp  77.8  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00617567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2126    84.95 
 
 		 1256 bp  73.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00875728  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4272  site-specific recombinase, phage integrase family protein  85.71 
 
 		 1266 bp  65.9  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.451693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0871  integrase family protein  91.11 
 
 		 1260 bp  58  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3314  site-specific recombinase, phage integrase family protein  84.42 
 
 		 1263 bp  58  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.426306  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1766  integrase family protein  89.58 
 
 		 1278 bp  56  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0264741  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2887  phage integrase family protein  94.44 
 
 		 1251 bp  56  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.416458  normal  0.252984 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3676  integrase family protein  92.11 
 
 		 1266 bp  52  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329272  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0447  integrase family protein  83.12 
 
 		 1260 bp  50.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0718  integrase family protein  93.94 
 
 		 1260 bp  50.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04100  hypothetical protein  93.75 
 
 		 1191 bp  48.1  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4753  phage integrase family site specific recombinase  93.75 
 
 		 1266 bp  48.1  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4051  phage integrase family site specific recombinase  83.82 
 
 		 1260 bp  48.1  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102635  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3727  integrase family protein  93.75 
 
 		 1191 bp  48.1  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04136  predicted integrase  93.75 
 
 		 1191 bp  48.1  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>