21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1510 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1510    100 
 
 		 264 bp  523  1e-147  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1514  integrase family protein  93.62 
 
 		 1272 bp  208  6e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1693  integrase family protein  87.94 
 
 		 1272 bp  145  7e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1465    86.67 
 
 		 813 bp  83.8  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000159039  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1588    86 
 
 		 1184 bp  79.8  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0979  site-specific recombinase, phage integrase family protein  84.38 
 
 		 1263 bp  71.9  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000444866  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2174    89.83 
 
 		 1256 bp  69.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00617567  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1478    87.88 
 
 		 474 bp  67.9  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0501  integrase family protein  87.14 
 
 		 1260 bp  67.9  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2104  phage integrase family site specific recombinase  95.12 
 
 		 1263 bp  65.9  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000885987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1656    83.33 
 
 		 1263 bp  63.9  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0164241  hitchhiker  0.00341593 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1669    83.33 
 
 		 1263 bp  63.9  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184902  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2126    88.14 
 
 		 1256 bp  61.9  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00875728  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3412  integrase family protein  85.71 
 
 		 1275 bp  60  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0858  integrase family protein  84.51 
 
 		 1260 bp  54  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3034  integrase family protein  84.29 
 
 		 1260 bp  52  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3419  integrase family protein  84.29 
 
 		 1260 bp  52  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.837092  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3702  integrase family protein  88.64 
 
 		 1257 bp  48.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0871  integrase family protein  96.3 
 
 		 1260 bp  46.1  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0447  integrase family protein  89.74 
 
 		 1260 bp  46.1  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0718  integrase family protein  96.3 
 
 		 1260 bp  46.1  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>