23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A2174 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A2174    100 
 
 		 1256 bp  2490    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00617567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2126    98.84 
 
 		 1256 bp  2284    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00875728  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1656    81.03 
 
 		 1263 bp  444  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0164241  hitchhiker  0.00341593 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1669    80.93 
 
 		 1263 bp  436  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184902  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0979  site-specific recombinase, phage integrase family protein  80.6 
 
 		 1263 bp  412  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000444866  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1514  integrase family protein  79.43 
 
 		 1272 bp  172  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2104  phage integrase family site specific recombinase  84.55 
 
 		 1263 bp  93.7  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000885987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1693  integrase family protein  84.87 
 
 		 1272 bp  93.7  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1588    82.01 
 
 		 1184 bp  77.8  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2343  hypothetical protein  91.38 
 
 		 150 bp  75.8  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.438827  hitchhiker  0.000697256 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1510    89.83 
 
 		 264 bp  69.9  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1465    84.78 
 
 		 813 bp  63.9  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000159039  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0871  integrase family protein  81.82 
 
 		 1260 bp  60  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2068  integrase  90 
 
 		 1275 bp  60  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000306631  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0809  phage integrase family site specific recombinase  84.42 
 
 		 1260 bp  58  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0718  integrase family protein  86.15 
 
 		 1260 bp  58  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3412  integrase family protein  96.88 
 
 		 1275 bp  56  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0501  integrase family protein  85.29 
 
 		 1260 bp  56  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2459  integrase family protein  83.75 
 
 		 1287 bp  56  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0447  integrase family protein  94.29 
 
 		 1260 bp  54  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3419  integrase family protein  85.48 
 
 		 1260 bp  52  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.837092  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1766  integrase family protein  83.12 
 
 		 1278 bp  50.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0264741  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0858  integrase family protein  93.75 
 
 		 1260 bp  48.1  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>