More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_4341 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_4341  iron ABC transporter, permease protein FitC  100 
 
 
327 aa  620  1e-177  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3321  iron ABC transporter, permease protein FitC  98.78 
 
 
327 aa  613  1e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.163733 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3440  transport system permease protein  77.61 
 
 
326 aa  427  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1735  transport system permease protein  43.91 
 
 
347 aa  224  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1524  transport system permease protein  41.54 
 
 
329 aa  208  8e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0464  transport system permease protein  39.45 
 
 
336 aa  203  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2435  transport system permease protein  43.63 
 
 
340 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  unclonable  0.00000000058625 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0644  transport system permease protein  40.4 
 
 
342 aa  201  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0331  transport system permease protein  42.19 
 
 
334 aa  199  5e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2939  transport system permease protein  41.05 
 
 
329 aa  199  7.999999999999999e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0526  iron compound ABC transporter, permease  41.64 
 
 
340 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.8853300000000003e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06008  hypothetical protein  40.74 
 
 
338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0671  iron compound ABC transporter, permease protein  41.64 
 
 
334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1714100000000002e-34 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0526  iron compound ABC transporter, permease  41.64 
 
 
340 aa  196  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247023  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3035  transport system permease protein  39.74 
 
 
322 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0744  iron compound ABC transporter, permease protein  41.64 
 
 
334 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000162191  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3086  transport system permease protein  39.74 
 
 
322 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.344068  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0582  iron compound ABC transporter permease  41.3 
 
 
340 aa  196  6e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000513454  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0551  transport system permease protein  40.91 
 
 
332 aa  196  6e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0616  iron compound ABC transporter permease protein  41.3 
 
 
334 aa  196  6e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000222704  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2438  transport system permease protein  42.95 
 
 
363 aa  195  8.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0761977  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37320  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  39.2 
 
 
374 aa  193  3e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0338  ABC-type Fe3+-siderophore transport system inner membrane subunit  43.67 
 
 
366 aa  194  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.552236  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3467  transport system permease protein  41.61 
 
 
341 aa  192  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743348  hitchhiker  0.00246309 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0684  iron compound ABC transporter, permease protein  41.64 
 
 
334 aa  192  8e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0653  iron compound ABC transporter, permease protein  38.7 
 
 
334 aa  191  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000463622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4684  iron compound ABC transporter, permease protein  38.7 
 
 
334 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.055956  hitchhiker  3.06185e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0530  transport system permease protein  41.3 
 
 
334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00110825  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3934  transport system permease protein  45.51 
 
 
352 aa  189  4e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3504  iron compound ABC transporter, permease protein  40.07 
 
 
344 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36340  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  43.85 
 
 
368 aa  188  9e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2086  transport system permease protein  39.87 
 
 
332 aa  188  9e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.180942  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3734  transport system permease protein  44.52 
 
 
363 aa  187  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3487  iron compound ABC transporter, permease protein  40.07 
 
 
344 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000659381  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3190  ferrichrome transport system permease  39.4 
 
 
344 aa  187  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000029437  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0414  transport system permease protein  48.03 
 
 
335 aa  187  3e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0692  transport system permease protein  36.49 
 
 
333 aa  186  4e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0356  transport system permease protein  43.13 
 
 
353 aa  186  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3187  transport system permease protein  40.07 
 
 
344 aa  186  5e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.117806  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1774  iron compound ABC transporter, permease protein  39.74 
 
 
344 aa  186  6e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000671836  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3277  iron compound ABC transporter permease  39.4 
 
 
344 aa  185  9e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000446459  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3247  ferrichrome transport system permease  39.4 
 
 
344 aa  185  9e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.1926e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3534  iron compound ABC transporter permease protein  39.4 
 
 
344 aa  185  9e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.351837  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1986  transport system permease protein  38.72 
 
 
333 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3474  iron compound ABC transporter, permease protein  40.73 
 
 
344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.712456  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1241  transport system permease protein  43.67 
 
 
353 aa  183  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00596239  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1623  transport system permease protein  45 
 
 
354 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3491  iron compound ABC transporter, permease protein  39.32 
 
 
298 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1776  iron compound ABC transporter, permease protein  35.08 
 
 
343 aa  181  2e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0851  transport system permease protein  36.96 
 
 
351 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.847344  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1326  transport system permease protein  41.04 
 
 
358 aa  181  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0395439  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7986  ABC transporter, permease, Fe3+-siderophore transport system  40.78 
 
 
350 aa  179  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121274  normal  0.17606 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4295  transport system permease protein  39.87 
 
 
347 aa  179  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2492  transport system permease protein  42.25 
 
 
340 aa  179  4.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.3582 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4231  ferric vibriobactin ABC transporter permease protein  40.32 
 
 
344 aa  179  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.866695  normal  0.0198027 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19090  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  43.25 
 
 
355 aa  178  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0971068 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  37.32 
 
 
342 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  36.96 
 
 
345 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2013  transport system permease protein  42.62 
 
 
343 aa  176  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0139655  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7290  ABC transporter membrane spanning protein (iron(III) dicitrate)  37.95 
 
 
342 aa  177  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1736  transport system permease protein  39.25 
 
 
351 aa  176  5e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.914625  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2265  transport system permease protein  40.43 
 
 
333 aa  176  5e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  42.03 
 
 
325 aa  176  7e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4897  transport system permease protein  40.54 
 
 
345 aa  174  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0357516  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  38.21 
 
 
366 aa  175  9.999999999999999e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2669  transport system permease protein  39.47 
 
 
340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0552  transport system permease protein  36.52 
 
 
326 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  39.66 
 
 
330 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0360927 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02570  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  38.43 
 
 
351 aa  172  6.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.103691  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5336  transport system permease protein  41.88 
 
 
347 aa  172  7.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.395947 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2415  transport system permease protein  39.93 
 
 
333 aa  172  7.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5748  transport system permease protein  39.27 
 
 
337 aa  172  9e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  34.45 
 
 
336 aa  171  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3186  transport system permease protein  36.78 
 
 
338 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12922  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  33.33 
 
 
337 aa  171  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0685  iron compound ABC transporter, permease protein  36.69 
 
 
352 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4449  iron compound ABC transporter, permease protein  36.96 
 
 
342 aa  170  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3189  iron compound ABC transporter, permease  36.47 
 
 
338 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.260495  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4596  iron compound ABC transporter permease protein  36.96 
 
 
342 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4448  iron compound ABC transporter, permease protein  36.96 
 
 
342 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3637  transport system permease protein  39.29 
 
 
340 aa  171  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.985865  normal  0.0127485 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4215  transport system permease protein  36.59 
 
 
342 aa  170  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4264  iron compound ABC transporter permease  36.96 
 
 
345 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4101  iron compound ABC transporter, permease  36.96 
 
 
345 aa  170  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1116  ABC transporter permease  32.86 
 
 
343 aa  170  3e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20810  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  40.44 
 
 
339 aa  170  3e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00921344 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2207  transport system permease protein  34.34 
 
 
343 aa  169  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.748712  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2245  transport system permease protein  34.34 
 
 
343 aa  169  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.148994  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3486  iron compound ABC transporter, permease protein  36.12 
 
 
338 aa  169  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00341334  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3502  iron compound ABC transporter, permease protein  36.78 
 
 
338 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4865  ABC transporter, iron chelate uptake transporter (FeCT) family, permease protein  39.31 
 
 
318 aa  169  5e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.737377 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3730  transport system permease protein  36.53 
 
 
350 aa  169  5e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1968  transport system permease protein  36.76 
 
 
349 aa  169  6e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000115433  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3276  iron compound ABC transporter permease  36.17 
 
 
338 aa  169  7e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0883377  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3533  iron compound ABC transporter permease protein  36.17 
 
 
338 aa  169  7e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.447967  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0745  iron compound ABC transporter, permease protein  37.01 
 
 
352 aa  169  7e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4683  iron compound ABC transporter, permease protein  37.34 
 
 
352 aa  169  8e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.106219  hitchhiker  2.60339e-21 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1284  transport system permease protein  39.46 
 
 
319 aa  169  8e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.348049  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1775  iron compound ABC transporter, permease protein  37.58 
 
 
338 aa  168  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000327409  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3473  iron compound ABC transporter, permease protein  36.17 
 
 
338 aa  168  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>