More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3321 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3321  iron ABC transporter, permease protein FitC  100 
 
 		 327 aa  621  1e-177  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.163733 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4341  iron ABC transporter, permease protein FitC  98.78 
 
 		 327 aa  613  1e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3440  transport system permease protein  77.3 
 
 		 326 aa  428  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1735  transport system permease protein  44.55 
 
 		 347 aa  227  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1524  transport system permease protein  41.85 
 
 		 329 aa  210  3e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2435  transport system permease protein  43.95 
 
 		 340 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  unclonable  0.00000000058625 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0464  transport system permease protein  39.45 
 
 		 336 aa  202  6e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0644  transport system permease protein  40.73 
 
 		 342 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2939  transport system permease protein  41.67 
 
 		 329 aa  200  3e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0331  transport system permease protein  42.19 
 
 		 334 aa  199  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0526  iron compound ABC transporter, permease  41.3 
 
 		 340 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.8853300000000003e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06008  hypothetical protein  40.74 
 
 		 338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0671  iron compound ABC transporter, permease protein  41.3 
 
 		 334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1714100000000002e-34 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0744  iron compound ABC transporter, permease protein  41.3 
 
 		 334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000162191  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3086  transport system permease protein  40.07 
 
 		 322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.344068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3035  transport system permease protein  40.07 
 
 		 322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0526  iron compound ABC transporter, permease  41.3 
 
 		 340 aa  196  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247023  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0551  transport system permease protein  40.91 
 
 		 332 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0582  iron compound ABC transporter permease  40.96 
 
 		 340 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000513454  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2438  transport system permease protein  45.29 
 
 		 363 aa  196  5.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0761977  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0616  iron compound ABC transporter permease protein  40.96 
 
 		 334 aa  196  6e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000222704  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0338  ABC-type Fe3+-siderophore transport system inner membrane subunit  44.33 
 
 		 366 aa  195  7e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.552236  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37320  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  39.33 
 
 		 374 aa  194  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0653  iron compound ABC transporter, permease protein  39.01 
 
 		 334 aa  193  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000463622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4684  iron compound ABC transporter, permease protein  39.01 
 
 		 334 aa  193  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.055956  hitchhiker  3.06185e-21 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3467  transport system permease protein  41.95 
 
 		 341 aa  193  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743348  hitchhiker  0.00246309 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0684  iron compound ABC transporter, permease protein  41.3 
 
 		 334 aa  192  8e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0530  transport system permease protein  41.3 
 
 		 334 aa  192  9e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00110825  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3934  transport system permease protein  46.18 
 
 		 352 aa  191  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36340  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  44.52 
 
 		 368 aa  191  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3734  transport system permease protein  45.18 
 
 		 363 aa  190  4e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2086  transport system permease protein  39.87 
 
 		 332 aa  189  5e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.180942  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1986  transport system permease protein  39.06 
 
 		 333 aa  189  8e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0414  transport system permease protein  48.68 
 
 		 335 aa  189  8e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3504  iron compound ABC transporter, permease protein  40.07 
 
 		 344 aa  189  8e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3190  ferrichrome transport system permease  39.4 
 
 		 344 aa  187  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000029437  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3487  iron compound ABC transporter, permease protein  40.07 
 
 		 344 aa  186  4e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000659381  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0692  transport system permease protein  36.49 
 
 		 333 aa  186  4e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3187  transport system permease protein  40.07 
 
 		 344 aa  185  8e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.117806  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1774  iron compound ABC transporter, permease protein  39.74 
 
 		 344 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000671836  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3277  iron compound ABC transporter permease  39.4 
 
 		 344 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000446459  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3247  ferrichrome transport system permease  39.4 
 
 		 344 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.1926e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1623  transport system permease protein  45.33 
 
 		 354 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3534  iron compound ABC transporter permease protein  39.4 
 
 		 344 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.351837  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3474  iron compound ABC transporter, permease protein  40.4 
 
 		 344 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.712456  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1241  transport system permease protein  44 
 
 		 353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00596239  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0356  transport system permease protein  42.81 
 
 		 353 aa  183  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0851  transport system permease protein  37.27 
 
 		 351 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.847344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4231  ferric vibriobactin ABC transporter permease protein  40.97 
 
 		 344 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.866695  normal  0.0198027 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3491  iron compound ABC transporter, permease protein  39.32 
 
 		 298 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7986  ABC transporter, permease, Fe3+-siderophore transport system  41.1 
 
 		 350 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121274  normal  0.17606 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4295  transport system permease protein  39.87 
 
 		 347 aa  179  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1326  transport system permease protein  41.04 
 
 		 358 aa  179  5.999999999999999e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0395439  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1776  iron compound ABC transporter, permease protein  35.08 
 
 		 343 aa  178  1e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  36.52 
 
 		 345 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2265  transport system permease protein  40.43 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19090  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  43.6 
 
 		 355 aa  177  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0971068 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  36.88 
 
 		 342 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  42.18 
 
 		 325 aa  176  4e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2669  transport system permease protein  40.13 
 
 		 340 aa  176  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2013  transport system permease protein  42.95 
 
 		 343 aa  176  5e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0139655  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7290  ABC transporter membrane spanning protein (iron(III) dicitrate)  37.95 
 
 		 342 aa  176  6e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2492  transport system permease protein  41.55 
 
 		 340 aa  175  9e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.3582 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4897  transport system permease protein  40.33 
 
 		 345 aa  175  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0357516  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5336  transport system permease protein  42.53 
 
 		 347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.395947 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  38.21 
 
 		 366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3189  iron compound ABC transporter, permease  36.78 
 
 		 338 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.260495  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  39.73 
 
 		 330 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0360927 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5748  transport system permease protein  39.6 
 
 		 337 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3637  transport system permease protein  39.61 
 
 		 340 aa  173  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.985865  normal  0.0127485 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1736  transport system permease protein  38.63 
 
 		 351 aa  173  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.914625  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2415  transport system permease protein  40.28 
 
 		 333 aa  172  5e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0552  transport system permease protein  36.52 
 
 		 326 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02570  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  38.43 
 
 		 351 aa  172  6.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.103691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3502  iron compound ABC transporter, permease protein  37.24 
 
 		 338 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3486  iron compound ABC transporter, permease protein  37.39 
 
 		 338 aa  171  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00341334  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3276  iron compound ABC transporter permease  36.47 
 
 		 338 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0883377  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3533  iron compound ABC transporter permease protein  36.47 
 
 		 338 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.447967  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  34.76 
 
 		 336 aa  171  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3186  transport system permease protein  36.78 
 
 		 338 aa  170  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12922  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4449  iron compound ABC transporter, permease protein  36.52 
 
 		 342 aa  170  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4264  iron compound ABC transporter permease  36.52 
 
 		 345 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4101  iron compound ABC transporter, permease  36.52 
 
 		 345 aa  170  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4448  iron compound ABC transporter, permease protein  36.52 
 
 		 342 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4596  iron compound ABC transporter permease protein  36.52 
 
 		 342 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3473  iron compound ABC transporter, permease protein  36.47 
 
 		 338 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20810  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  40.75 
 
 		 339 aa  171  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00921344 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0685  iron compound ABC transporter, permease protein  36.69 
 
 		 352 aa  170  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1775  iron compound ABC transporter, permease protein  37.91 
 
 		 338 aa  170  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000327409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2408  transport system permease protein  34.24 
 
 		 335 aa  170  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00436362  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4215  transport system permease protein  36.17 
 
 		 342 aa  170  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3490  iron compound ABC transporter, permease protein  36.17 
 
 		 338 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1968  transport system permease protein  37.38 
 
 		 349 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000115433  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  33.33 
 
 		 337 aa  169  4e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3730  transport system permease protein  36.84 
 
 		 350 aa  169  5e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3748  iron compound ABC transporter, permease protein  33.9 
 
 		 335 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000332198 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3482  iron(III) dicitrate transport system, permease  33.9 
 
 		 335 aa  169  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155404  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1042  transport system permease protein  39.74 
 
 		 335 aa  169  5e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4865  ABC transporter, iron chelate uptake transporter (FeCT) family, permease protein  39.38 
 
 		 318 aa  169  5e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.737377 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3246  iron compound ABC transporter, permease  36.17 
 
 		 338 aa  169  7e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>