21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2921 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_2921  replication of DNA  100 
 
 		 273 aa  567  1e-161  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.274464  hitchhiker  6.39526e-16 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0624  DNA replication protein gp18  66.67 
 
 		 277 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00127495 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0384  DNA replication protein gp18  50.58 
 
 		 271 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0966455  hitchhiker  0.00000000000236015 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0784  phage replication protein O  43.36 
 
 		 269 aa  220  9.999999999999999e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.133854  hitchhiker  0.00108821 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1119  replication protein O  35.43 
 
 		 301 aa  122  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.676639  normal  0.807311 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2834  replication protein O  39.2 
 
 		 294 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.119993  normal  0.314144 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3234  phage replication protein O  38.6 
 
 		 334 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.69672  hitchhiker  0.00032454 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0620  gp59  39.74 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0966725  decreased coverage  0.000000533043 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00721  hypothetical protein  41.79 
 
 		 299 aa  103  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.180512  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10024  DNA replication protein  41.79 
 
 		 299 aa  103  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.222522  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3553  replication protein O  38.1 
 
 		 312 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.609117  hitchhiker  1.07069e-17 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2985  prophage LambdaSo, replication protein O  38.6 
 
 		 338 aa  91.7  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1600  replication protein O  37.04 
 
 		 274 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108341 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2617  phage replication protein O  37.72 
 
 		 355 aa  89.4  7e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.398794  hitchhiker  0.0000603764 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3894  phage replication protein O, putative  26.67 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393455 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1053  gifsy-1 prophage PrpO  37.62 
 
 		 327 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0283915  hitchhiker  0.00000186889 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2284  gifsy-1 prophage PrpO  37.62 
 
 		 325 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0857509  normal  0.0949977 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1083  gifsy-1 prophage PrpO  37.62 
 
 		 327 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00906063  hitchhiker  0.00000468495 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2245  hypothetical protein  36.67 
 
 		 347 aa  62  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000488792  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2249  hypothetical protein  34.44 
 
 		 354 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119994  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1139  replication protein  30.68 
 
 		 326 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00398063  hitchhiker  2.1893400000000002e-24 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>