28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2617 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2617  phage replication protein O  100 
 
 
355 aa  739    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.398794  hitchhiker  0.0000603764 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2985  prophage LambdaSo, replication protein O  87.54 
 
 
338 aa  607  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3234  phage replication protein O  39.31 
 
 
334 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.69672  hitchhiker  0.00032454 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1119  replication protein O  39.46 
 
 
301 aa  176  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.676639  normal  0.807311 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10024  DNA replication protein  35.74 
 
 
299 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.222522  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00721  hypothetical protein  35.74 
 
 
299 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.180512  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3553  replication protein O  35.34 
 
 
312 aa  161  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.609117  hitchhiker  1.07069e-17 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1600  replication protein O  39.48 
 
 
274 aa  161  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000108341 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1014  phage replication protein O domain-containing protein  47.66 
 
 
308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.167273  unclonable  0.00000357424 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4446  phage O protein family  29.17 
 
 
313 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0401993  unclonable  0.00000000141211 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1433  phage O protein family  25.9 
 
 
320 aa  97.4  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000630558  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2276  phage O protein  25.84 
 
 
295 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000295472  hitchhiker  0.000000000000106842 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1259  phage O family protein  37.93 
 
 
315 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000280847  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01536  conserved hypothetical protein  37.38 
 
 
339 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0921413  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01527  hypothetical protein  37.38 
 
 
321 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0517031  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1775  phage O family protein  37.38 
 
 
321 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2061  hypothetical protein  37.38 
 
 
304 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.927718  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2921  replication of DNA  37.72 
 
 
273 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.274464  hitchhiker  6.39526e-16 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2834  replication protein O  41.94 
 
 
294 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.119993  normal  0.314144 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0624  DNA replication protein gp18  36.44 
 
 
277 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00127495 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0384  DNA replication protein gp18  36.44 
 
 
271 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0966455  hitchhiker  0.00000000000236015 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2284  gifsy-1 prophage PrpO  41.75 
 
 
325 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0857509  normal  0.0949977 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1083  gifsy-1 prophage PrpO  41.75 
 
 
327 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00906063  hitchhiker  0.00000468495 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1053  gifsy-1 prophage PrpO  41.75 
 
 
327 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0283915  hitchhiker  0.00000186889 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5817  hypothetical protein  35.35 
 
 
282 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0784  phage replication protein O  32.59 
 
 
269 aa  76.6  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.133854  hitchhiker  0.00108821 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0620  gp59  35.35 
 
 
286 aa  76.3  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0966725  decreased coverage  0.000000533043 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2836  hypothetical protein  25.74 
 
 
367 aa  44.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>