18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_2249 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_2249  hypothetical protein  100 
 
 
354 aa  736    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119994  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2245  hypothetical protein  47.91 
 
 
347 aa  333  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000488792  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1139  replication protein  67.28 
 
 
326 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00398063  hitchhiker  2.1893400000000002e-24 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3450  hypothetical protein  40.86 
 
 
254 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3535  hypothetical protein  39.69 
 
 
252 aa  162  6e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942352  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3819  hypothetical protein  39.69 
 
 
252 aa  162  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3455  hypothetical protein  39.69 
 
 
252 aa  161  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2994  primosome, DnaD subunit  54.21 
 
 
430 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2616  hypothetical protein  35.82 
 
 
306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00545088 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01536  conserved hypothetical protein  42.75 
 
 
339 aa  103  6e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0921413  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01527  hypothetical protein  42.75 
 
 
321 aa  102  7e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0517031  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1775  phage O family protein  40.14 
 
 
321 aa  101  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2061  hypothetical protein  40.8 
 
 
304 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.927718  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0784  phage replication protein O  50.54 
 
 
269 aa  89  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.133854  hitchhiker  0.00108821 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0089  hypothetical protein  36.63 
 
 
367 aa  77.4  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0984829  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0384  DNA replication protein gp18  38.04 
 
 
271 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0966455  hitchhiker  0.00000000000236015 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0624  DNA replication protein gp18  33.7 
 
 
277 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00127495 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2921  replication of DNA  34.44 
 
 
273 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.274464  hitchhiker  6.39526e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>