21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0784 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_0784  phage replication protein O  100 
 
 
269 aa  546  1e-154  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.133854  hitchhiker  0.00108821 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0624  DNA replication protein gp18  44.4 
 
 
277 aa  237  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00127495 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2921  replication of DNA  43.36 
 
 
273 aa  220  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.274464  hitchhiker  6.39526e-16 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0384  DNA replication protein gp18  42.07 
 
 
271 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0966455  hitchhiker  0.00000000000236015 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00721  hypothetical protein  62.99 
 
 
299 aa  198  9e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.180512  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10024  DNA replication protein  62.99 
 
 
299 aa  198  9e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.222522  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3553  replication protein O  58.68 
 
 
312 aa  188  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.609117  hitchhiker  1.07069e-17 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0620  gp59  48.08 
 
 
286 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0966725  decreased coverage  0.000000533043 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3234  phage replication protein O  38.92 
 
 
334 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.69672  hitchhiker  0.00032454 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2834  replication protein O  37.43 
 
 
294 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.119993  normal  0.314144 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1119  replication protein O  42.15 
 
 
301 aa  95.5  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.676639  normal  0.807311 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2249  hypothetical protein  50 
 
 
354 aa  87  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119994  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1139  replication protein  50.55 
 
 
326 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00398063  hitchhiker  2.1893400000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2284  gifsy-1 prophage PrpO  31.61 
 
 
325 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0857509  normal  0.0949977 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1053  gifsy-1 prophage PrpO  31.61 
 
 
327 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0283915  hitchhiker  0.00000186889 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1083  gifsy-1 prophage PrpO  31.61 
 
 
327 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00906063  hitchhiker  0.00000468495 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3894  phage replication protein O, putative  29.32 
 
 
276 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00393455 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2245  hypothetical protein  42.39 
 
 
347 aa  77.8  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000488792  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2617  phage replication protein O  32.59 
 
 
355 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.398794  hitchhiker  0.0000603764 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2985  prophage LambdaSo, replication protein O  32.14 
 
 
338 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1600  replication protein O  32.77 
 
 
274 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000108341 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>