26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1600 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1600  replication protein O  100 
 
 
274 aa  565  1e-160  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000108341 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3234  phage replication protein O  96.95 
 
 
334 aa  530  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.69672  hitchhiker  0.00032454 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3553  replication protein O  68.68 
 
 
312 aa  359  3e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.609117  hitchhiker  1.07069e-17 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10024  DNA replication protein  69.08 
 
 
299 aa  358  4e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.222522  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00721  hypothetical protein  69.08 
 
 
299 aa  358  4e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.180512  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1119  replication protein O  62.84 
 
 
301 aa  338  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.676639  normal  0.807311 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1014  phage replication protein O domain-containing protein  45.99 
 
 
308 aa  207  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.167273  unclonable  0.00000357424 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2834  replication protein O  69.17 
 
 
294 aa  182  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.119993  normal  0.314144 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2985  prophage LambdaSo, replication protein O  39.48 
 
 
338 aa  169  4e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2617  phage replication protein O  39.48 
 
 
355 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.398794  hitchhiker  0.0000603764 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0384  DNA replication protein gp18  41.43 
 
 
271 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0966455  hitchhiker  0.00000000000236015 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0624  DNA replication protein gp18  40.54 
 
 
277 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00127495 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1433  phage O protein family  34.78 
 
 
320 aa  94  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000630558  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1259  phage O family protein  35.06 
 
 
315 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000280847  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4446  phage O protein family  27.59 
 
 
313 aa  92  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0401993  unclonable  0.00000000141211 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1775  phage O family protein  36.8 
 
 
321 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2276  phage O protein  33.96 
 
 
295 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000295472  hitchhiker  0.000000000000106842 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2921  replication of DNA  37.04 
 
 
273 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.274464  hitchhiker  6.39526e-16 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2061  hypothetical protein  35.11 
 
 
304 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.927718  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01527  hypothetical protein  35.11 
 
 
321 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0517031  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01536  conserved hypothetical protein  35.11 
 
 
339 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0921413  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5817  hypothetical protein  45.45 
 
 
282 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0784  phage replication protein O  32.77 
 
 
269 aa  63.2  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.133854  hitchhiker  0.00108821 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0620  gp59  29.31 
 
 
286 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0966725  decreased coverage  0.000000533043 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0975  hypothetical protein  30.49 
 
 
229 aa  43.5  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.308507  hitchhiker  0.000000000785859 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2836  hypothetical protein  26.04 
 
 
367 aa  43.5  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>