24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2834 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A2834  replication protein O  100 
 
 		 294 aa  605  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.119993  normal  0.314144 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3234  phage replication protein O  73.89 
 
 		 334 aa  266  2e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.69672  hitchhiker  0.00032454 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1600  replication protein O  69.17 
 
 		 274 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108341 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1083  gifsy-1 prophage PrpO  35.62 
 
 		 327 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00906063  hitchhiker  0.00000468495 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2284  gifsy-1 prophage PrpO  35.62 
 
 		 325 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0857509  normal  0.0949977 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1053  gifsy-1 prophage PrpO  35.62 
 
 		 327 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0283915  hitchhiker  0.00000186889 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1119  replication protein O  44.71 
 
 		 301 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.676639  normal  0.807311 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0384  DNA replication protein gp18  47.89 
 
 		 271 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0966455  hitchhiker  0.00000000000236015 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0624  DNA replication protein gp18  47.92 
 
 		 277 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00127495 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3553  replication protein O  37.57 
 
 		 312 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.609117  hitchhiker  1.07069e-17 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2921  replication of DNA  39.2 
 
 		 273 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.274464  hitchhiker  6.39526e-16 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00721  hypothetical protein  37.02 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.180512  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10024  DNA replication protein  37.02 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.222522  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0784  phage replication protein O  37.43 
 
 		 269 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.133854  hitchhiker  0.00108821 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2284  protein of unknown function DUF1376  42.2 
 
 		 285 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.492747  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0620  gp59  31.35 
 
 		 286 aa  90.5  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0966725  decreased coverage  0.000000533043 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2985  prophage LambdaSo, replication protein O  33.33 
 
 		 338 aa  88.2  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2617  phage replication protein O  41.94 
 
 		 355 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.398794  hitchhiker  0.0000603764 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1033  gp60  29.36 
 
 		 311 aa  52.4  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1672  gp60  29.36 
 
 		 311 aa  52.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0382632  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3439  putative transcriptional regulator  32.86 
 
 		 249 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119584  unclonable  9.09525e-17 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1845  hypothetical protein  34.57 
 
 		 248 aa  49.7  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.918053  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1906  GP60  30.59 
 
 		 339 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000000738533  normal  0.0210495 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1303  C4-dicarboxylate transporter family protein, DctQ subunit  34.72 
 
 		 304 aa  42.7  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.187485  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>