27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2985 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2985  prophage LambdaSo, replication protein O  100 
 
 		 338 aa  705    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2617  phage replication protein O  87.54 
 
 		 355 aa  607  1e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.398794  hitchhiker  0.0000603764 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3234  phage replication protein O  40.08 
 
 		 334 aa  195  9e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.69672  hitchhiker  0.00032454 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1119  replication protein O  38.55 
 
 		 301 aa  179  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.676639  normal  0.807311 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1600  replication protein O  39.48 
 
 		 274 aa  169  6e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108341 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3553  replication protein O  35.34 
 
 		 312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.609117  hitchhiker  1.07069e-17 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10024  DNA replication protein  35.23 
 
 		 299 aa  162  6e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.222522  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00721  hypothetical protein  35.23 
 
 		 299 aa  162  6e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.180512  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1014  phage replication protein O domain-containing protein  50.43 
 
 		 308 aa  123  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.167273  unclonable  0.00000357424 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4446  phage O protein family  28.1 
 
 		 313 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0401993  unclonable  0.00000000141211 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1433  phage O protein family  28.52 
 
 		 320 aa  103  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000630558  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2276  phage O protein  28.09 
 
 		 295 aa  102  9e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000295472  hitchhiker  0.000000000000106842 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1259  phage O family protein  40.54 
 
 		 315 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000280847  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1775  phage O family protein  39.62 
 
 		 321 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01527  hypothetical protein  39.05 
 
 		 321 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0517031  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2061  hypothetical protein  39.05 
 
 		 304 aa  92  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.927718  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01536  conserved hypothetical protein  39.05 
 
 		 339 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0921413  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2921  replication of DNA  38.6 
 
 		 273 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.274464  hitchhiker  6.39526e-16 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2834  replication protein O  33.33 
 
 		 294 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.119993  normal  0.314144 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0624  DNA replication protein gp18  30.69 
 
 		 277 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00127495 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1083  gifsy-1 prophage PrpO  42.72 
 
 		 327 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00906063  hitchhiker  0.00000468495 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2284  gifsy-1 prophage PrpO  42.72 
 
 		 325 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0857509  normal  0.0949977 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1053  gifsy-1 prophage PrpO  42.72 
 
 		 327 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0283915  hitchhiker  0.00000186889 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0384  DNA replication protein gp18  35.48 
 
 		 271 aa  83.6  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0966455  hitchhiker  0.00000000000236015 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5817  hypothetical protein  36.36 
 
 		 282 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0620  gp59  36.36 
 
 		 286 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0966725  decreased coverage  0.000000533043 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0784  phage replication protein O  32.14 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.133854  hitchhiker  0.00108821 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>