29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_3553 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_3553  replication protein O  100 
 
 		 312 aa  646    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.609117  hitchhiker  1.07069e-17 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10024  DNA replication protein  95.19 
 
 		 299 aa  606  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.222522  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00721  hypothetical protein  95.19 
 
 		 299 aa  606  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.180512  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3234  phage replication protein O  67.83 
 
 		 334 aa  411  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.69672  hitchhiker  0.00032454 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1600  replication protein O  68.68 
 
 		 274 aa  359  4e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108341 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1119  replication protein O  56.09 
 
 		 301 aa  345  6e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.676639  normal  0.807311 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1014  phage replication protein O domain-containing protein  49.12 
 
 		 308 aa  205  8e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.167273  unclonable  0.00000357424 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0784  phage replication protein O  58.68 
 
 		 269 aa  188  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.133854  hitchhiker  0.00108821 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2985  prophage LambdaSo, replication protein O  35.34 
 
 		 338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2617  phage replication protein O  35.34 
 
 		 355 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.398794  hitchhiker  0.0000603764 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0620  gp59  48.21 
 
 		 286 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0966725  decreased coverage  0.000000533043 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2834  replication protein O  37.57 
 
 		 294 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.119993  normal  0.314144 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0384  DNA replication protein gp18  40.82 
 
 		 271 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0966455  hitchhiker  0.00000000000236015 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0624  DNA replication protein gp18  40.82 
 
 		 277 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00127495 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2921  replication of DNA  38.1 
 
 		 273 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.274464  hitchhiker  6.39526e-16 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1053  gifsy-1 prophage PrpO  35.48 
 
 		 327 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0283915  hitchhiker  0.00000186889 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2284  gifsy-1 prophage PrpO  35.48 
 
 		 325 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0857509  normal  0.0949977 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1083  gifsy-1 prophage PrpO  35.48 
 
 		 327 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00906063  hitchhiker  0.00000468495 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1433  phage O protein family  38.66 
 
 		 320 aa  92.4  8e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000630558  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1259  phage O family protein  35.94 
 
 		 315 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000280847  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2276  phage O protein  37.82 
 
 		 295 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000295472  hitchhiker  0.000000000000106842 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1775  phage O family protein  39.29 
 
 		 321 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4446  phage O protein family  34.9 
 
 		 313 aa  89.7  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0401993  unclonable  0.00000000141211 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01536  conserved hypothetical protein  33.99 
 
 		 339 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0921413  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01527  hypothetical protein  33.99 
 
 		 321 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0517031  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2061  hypothetical protein  33.78 
 
 		 304 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.927718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5817  hypothetical protein  45.45 
 
 		 282 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0975  hypothetical protein  30.49 
 
 		 229 aa  44.3  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.308507  hitchhiker  0.000000000785859 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3894  phage replication protein O, putative  29.55 
 
 		 276 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393455 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>