150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1454 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1454  methylglyoxal synthase  100 
 
 		 143 aa  293  4e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.12396  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1322  methylglyoxal synthase  90.14 
 
 		 143 aa  265  1e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.631641  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1576  methylglyoxal synthase  89.44 
 
 		 143 aa  263  5.999999999999999e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0233  methylglyoxal synthase  51.16 
 
 		 144 aa  147  6e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_145  methylglyoxal synthase  51.16 
 
 		 144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0137  methylglyoxal synthase  51.16 
 
 		 144 aa  144  3e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0707  methylglyoxal synthase  50 
 
 		 120 aa  121  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2805  methylglyoxal synthase  46.09 
 
 		 133 aa  120  5e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.321447  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1275  methylglyoxal synthase  47.15 
 
 		 128 aa  118  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.418994  hitchhiker  0.00000238684 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0524  methylglyoxal synthase  50.89 
 
 		 126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1122  methylglyoxal synthase  46.55 
 
 		 126 aa  116  7.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0967  methylglyoxal synthase  48.18 
 
 		 123 aa  114  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2691  methylglyoxal synthase  45.38 
 
 		 152 aa  114  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1798  methylglyoxal synthase  43.48 
 
 		 123 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.061495  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1215  methylglyoxal synthase  43.7 
 
 		 152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.216968  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2484  methylglyoxal synthase  49.57 
 
 		 133 aa  112  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1163  methylglyoxal synthase  49.57 
 
 		 128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.618904  normal  0.0141735 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1309  methylglyoxal synthase  48.28 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.871383  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2192  methylglyoxal synthase  43.48 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2852  methylglyoxal synthase  44.17 
 
 		 152 aa  111  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.069917  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04890  Dephospho-CoA kinase  48.31 
 
 		 317 aa  111  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000544377  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2543  methylglyoxal synthase  44.54 
 
 		 152 aa  110  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00778094  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000319  methylglyoxal synthase  40.15 
 
 		 151 aa  110  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0496  methylglyoxal synthase  43.59 
 
 		 144 aa  110  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2123  methylglyoxal synthase  43.1 
 
 		 140 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.336211  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1443  methylglyoxal synthase  43.59 
 
 		 131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0250107  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1556  methylglyoxal synthase  43.59 
 
 		 131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0650  methylglyoxal synthase  38.64 
 
 		 151 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1257  methylglyoxal synthase  42.74 
 
 		 131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.390587  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1662  methylglyoxal synthase  43.59 
 
 		 131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1589  methylglyoxal synthase  43.59 
 
 		 131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1415  methylglyoxal synthase  43.59 
 
 		 131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0291451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1416  methylglyoxal synthase  43.59 
 
 		 131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.032143  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1700  methylglyoxal synthase  43.59 
 
 		 131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277502  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1627  methylglyoxal synthase  43.59 
 
 		 131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.15767 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3756  methylglyoxal synthase  43.59 
 
 		 131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1481  methylglyoxal synthase  51.96 
 
 		 119 aa  108  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06121  methylglyoxal synthase  39.39 
 
 		 151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1459  methylglyoxal synthase  43.59 
 
 		 131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0146321  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2126  methylglyoxal synthase  46.55 
 
 		 132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000882281  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0792  methylglyoxal synthase  47.01 
 
 		 140 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52468  normal  0.131121 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2625  methylglyoxal synthase  43.33 
 
 		 158 aa  107  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2719  methylglyoxal synthase  43.33 
 
 		 158 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1982  methylglyoxal synthase  46.15 
 
 		 143 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2382  methylglyoxal synthase  46.15 
 
 		 146 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1240  methylglyoxal synthase  43.33 
 
 		 158 aa  106  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.259258  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0987  methylglyoxal synthase  46.28 
 
 		 130 aa  106  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1881  methylglyoxal synthase  45.45 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.715757  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1390  methylglyoxal synthase  45.45 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1350  methylglyoxal synthase  42.28 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1079  methylglyoxal synthase  45.45 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.233114  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0788  methylglyoxal synthase  45.45 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0615906  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1235  methylglyoxal synthase  45.45 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1244  methylglyoxal synthase  45.45 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.473905  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0362  methylglyoxal synthase  45.45 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.607553  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0366  methylglyoxal synthase  44.74 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2526  methylglyoxal synthase  42.5 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.487727 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0918  methylglyoxal synthase  38.97 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.502742  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1097  methylglyoxal synthase  38.97 
 
 		 143 aa  104  3e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2185  methylglyoxal synthase  45.61 
 
 		 135 aa  104  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0445857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1760  methylglyoxal synthase  39.84 
 
 		 152 aa  104  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0497546  hitchhiker  0.0006316 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0594  methylglyoxal synthase  43.86 
 
 		 128 aa  104  4e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.444681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2329  methylglyoxal synthase  45.45 
 
 		 130 aa  103  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2207  methylglyoxal synthase  45.45 
 
 		 130 aa  103  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.093882  normal  0.861141 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1018  methylglyoxal synthase  44.63 
 
 		 130 aa  103  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.736302  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2291  methylglyoxal synthase  45.45 
 
 		 130 aa  103  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2314  methylglyoxal synthase  45.45 
 
 		 130 aa  103  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.659726 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1679  methylglyoxal synthase  45.45 
 
 		 130 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0255708  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0194  methylglyoxal synthase  43.64 
 
 		 122 aa  102  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2504  methylglyoxal synthase  44.44 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156833  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5618  methylglyoxal synthase  45.45 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0573538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3256  methylglyoxal synthase  45.61 
 
 		 129 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308691  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0241  methylglyoxal synthase  45.76 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0703  methylglyoxal synthase  37.96 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000171943 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1304  methylglyoxal synthase  45.61 
 
 		 129 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.206043  normal  0.073248 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2061  methylglyoxal synthase  44.74 
 
 		 129 aa  101  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337955  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1077  methylglyoxal synthase  40.52 
 
 		 119 aa  100  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2535  methylglyoxal synthase  39.34 
 
 		 154 aa  100  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000427082  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2651  methylglyoxal synthase  42.15 
 
 		 140 aa  100  7e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.957792  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3205  methylglyoxal synthase  39.34 
 
 		 154 aa  100  7e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00712521  normal  0.0289942 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2624  methylglyoxal synthase  39.34 
 
 		 154 aa  100  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.575879  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2133  methylglyoxal synthase  39.47 
 
 		 151 aa  100  8e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0525885  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1475  methylglyoxal synthase  40.83 
 
 		 152 aa  100  8e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.977307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3100  methylglyoxal synthase  40 
 
 		 159 aa  100  8e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000537533  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1265  methylglyoxal synthase  39.66 
 
 		 119 aa  100  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.357495  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0861  methylglyoxal synthase  39.06 
 
 		 153 aa  99.8  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142062  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0985  methylglyoxal synthase  38.33 
 
 		 135 aa  99  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0342245  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0042  methylglyoxal synthase  43.1 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.304097 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2527  methylglyoxal synthase  51.69 
 
 		 139 aa  99.4  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1706  methylglyoxal synthase  46.96 
 
 		 130 aa  99  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2367  methylglyoxal synthase  44.83 
 
 		 133 aa  98.6  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000264399  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2082  methylglyoxal synthase  40.35 
 
 		 120 aa  99.4  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2680  methylglyoxal synthase  39.17 
 
 		 152 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.788486  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1117  methylglyoxal synthase  38.33 
 
 		 152 aa  98.2  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000625657 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1185  methylglyoxal synthase  38.33 
 
 		 152 aa  98.2  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.408572  normal  0.64136 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00533  methylglyoxal synthase  39.34 
 
 		 136 aa  98.6  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1139  methylglyoxal synthase  38.33 
 
 		 152 aa  98.2  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.482721 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1151  methylglyoxal synthase  38.33 
 
 		 152 aa  98.2  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2633  methylglyoxal synthase  39.17 
 
 		 152 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.264102  hitchhiker  0.000000301541 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2156  methylglyoxal synthase  39.17 
 
 		 152 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.082443  normal  0.275466 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>