71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1164 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1164  UspA domain protein  100 
 
 
227 aa  467  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4531  sensor histidine kinase KdpD  38.17 
 
 
381 aa  106  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.797067  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0706  sensor histidine kinase KdpD  38.17 
 
 
382 aa  106  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0742  sensor histidine kinase KdpD  38.17 
 
 
384 aa  106  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.603225  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0897  sensor histidine kinase KdpD  38.17 
 
 
384 aa  105  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.744976  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0800  sensor histidine kinase KdpD  37.4 
 
 
381 aa  105  7e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.864791  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0657  osmosensitive K channel His kinase sensor  36.64 
 
 
381 aa  104  9e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0812  sensor histidine kinase KdpD  38.17 
 
 
384 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0650  sensor histidine kinase  37.4 
 
 
384 aa  103  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0627  osmosensitive K channel His kinase sensor  36.64 
 
 
381 aa  102  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0355424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0649  sensor histidine kinase  37.4 
 
 
384 aa  101  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.831843  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0818  sensor histidine kinase KdpD  37.4 
 
 
381 aa  101  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.23274e-52 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1191  osmosensitive K+ channel histidine kinase sensor subunit  34.35 
 
 
377 aa  77.8  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.588152  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4719  Osmosensitive K channel His kinase sensor  32.58 
 
 
377 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0711  Osmosensitive K channel His kinase sensor  31.11 
 
 
368 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0684  Osmosensitive K channel His kinase sensor  31.11 
 
 
368 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0254  Osmosensitive K channel His kinase sensor  32.35 
 
 
754 aa  67.8  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0190  osmosensitive K+ channel histidine kinase sensor subunit  33.08 
 
 
373 aa  66.6  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.921987  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0197  osmosensitive K+ channel histidine kinase sensor subunit  29.77 
 
 
396 aa  65.1  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.960003  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1482  Osmosensitive K channel His kinase sensor  29.46 
 
 
731 aa  60.8  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1874  Osmosensitive K channel His kinase sensor  26.77 
 
 
895 aa  58.2  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.743469  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1207  sensor protein KdpD  27.27 
 
 
895 aa  56.6  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00684772 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2214  sensor histidine kinase KdpD  25.2 
 
 
910 aa  56.6  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.428081  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0896  osmosensitive K+ channel His kinase sensor  28.24 
 
 
658 aa  53.9  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000123785 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2852  osmosensitive K+ channel His kinase sensor  25 
 
 
365 aa  53.9  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.656775  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4762  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  27.34 
 
 
850 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.400421  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1729  potassium-transporting ATPase D chain  29.71 
 
 
370 aa  53.1  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1103  sensor protein KdpD  26.9 
 
 
908 aa  52.4  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0538967  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3579  sensor protein KdpD  26.9 
 
 
908 aa  52.4  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1156  sensor protein KdpD  26.9 
 
 
908 aa  52.4  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.486498  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4607  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  26.56 
 
 
836 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4295  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  26.56 
 
 
836 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.537586  normal  0.556945 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4229  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  26.56 
 
 
836 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2823  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  21.88 
 
 
901 aa  50.4  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1245  sensor protein KdpD  25.56 
 
 
897 aa  50.8  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.011545  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1175  osmosensitive K channel signal transduction histidine kinase, sensor subunit KdpD  27.14 
 
 
389 aa  50.1  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0788  sensor protein KdpD  24.83 
 
 
894 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2961  sensor protein KdpD  24.83 
 
 
895 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.647759 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00643  hypothetical protein  24.83 
 
 
894 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2941  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  24.83 
 
 
894 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00652  fused sensory histidine kinase in two-component regulatory system with KdpE: signal sensing protein  24.83 
 
 
895 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2436  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  24.22 
 
 
888 aa  49.3  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.747553 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0721  sensor protein KdpD  24.83 
 
 
894 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.594911  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0742  sensor protein KdpD  24.83 
 
 
894 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.204063  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11046  two component system sensor histidine kinase kdpD  26.56 
 
 
860 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0508  osmosensitive K+ channel, histidine kinase sensor  23.44 
 
 
373 aa  48.9  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.831446  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0764  sensor protein KdpD  22.79 
 
 
894 aa  48.9  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0825  sensor protein KdpD  22.79 
 
 
894 aa  48.9  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0325382 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0861  sensor protein KdpD  22.79 
 
 
905 aa  48.9  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0751  sensor protein KdpD  22.79 
 
 
894 aa  48.9  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0811  sensor protein KdpD  22.79 
 
 
894 aa  48.9  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00623216  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0717  sensor protein KdpD  23.53 
 
 
894 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.649763  normal  0.772603 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0892  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  23.66 
 
 
902 aa  48.5  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3236  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  23.44 
 
 
900 aa  48.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.734401  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2483  sensor histidine kinase KdpD  24.22 
 
 
885 aa  48.1  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0554  sensor protein KdpD  24.83 
 
 
894 aa  48.1  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4089  Osmosensitive K channel His kinase sensor  27.34 
 
 
845 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1667  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  25.95 
 
 
897 aa  47.4  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1080  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  25.19 
 
 
902 aa  47  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.987638  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1215  sensor protein KdpD  23.45 
 
 
915 aa  46.6  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.693772  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4547  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  22.06 
 
 
907 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.657625 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6071  two component sensor kinase  25.95 
 
 
902 aa  45.8  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3227  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  23.08 
 
 
890 aa  45.8  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2605  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  21.32 
 
 
892 aa  45.4  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2290  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  23.81 
 
 
951 aa  44.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.014043  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2273  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  26.72 
 
 
895 aa  43.9  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1680  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  25.16 
 
 
961 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6335  sensory histidine kinase in two-component regulatory system wtih KdpE, regulation of potassium translocation  22.83 
 
 
905 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0342372 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3494  translation initiation factor IF-2  24.41 
 
 
370 aa  43.1  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1224  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  21.71 
 
 
889 aa  42  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2695  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  22.88 
 
 
897 aa  42  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0787652  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>