60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0542 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0542  hypothetical protein  100 
 
 		 518 aa  1075    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1410  glycosyl transferase family protein  48.1 
 
 		 826 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1660  glycosyl transferase family protein  42.92 
 
 		 232 aa  165  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014309  hitchhiker  0.00126456 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0059  hypothetical protein  23.88 
 
 		 244 aa  71.6  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.293695  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  27.12 
 
 		 785 aa  59.7  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1386  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 		 657 aa  58.2  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2052  glycosyl transferase family protein  31.9 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1248  glycosyl transferase family protein  23.7 
 
 		 249 aa  56.2  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.480822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0968  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 		 263 aa  54.7  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1288  glycosyl transferase family protein  32.63 
 
 		 379 aa  53.9  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.895631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1178  glycosyl transferase family protein  32.46 
 
 		 535 aa  52.8  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026276 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1388  glycosyl transferase family protein  26.52 
 
 		 421 aa  51.2  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.739804  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  24.09 
 
 		 1162 aa  50.4  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0291  UDP-glucose--lipooligosaccharide beta 1-4 glucosyltransferase  24.76 
 
 		 256 aa  50.4  0.00008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0225943  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1402  glycosyl transferase family protein  31.5 
 
 		 646 aa  50.1  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1982  glycosyl transferase family protein  26.11 
 
 		 256 aa  50.1  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1128  glycosyl transferase family 2  27.48 
 
 		 414 aa  49.7  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13820  hypothetical protein  22.17 
 
 		 407 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3892  glycosyl transferase family protein  29.09 
 
 		 255 aa  50.1  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5618  family 2 glycosyl transferase  33.33 
 
 		 356 aa  49.7  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2091  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 		 260 aa  48.9  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2005  glycosyl transferase family 2  26.79 
 
 		 257 aa  48.5  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1254  glycosyl transferase family 2  28.08 
 
 		 253 aa  48.5  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00808348  normal  0.786627 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2400  glycosyl transferase family 2  26.79 
 
 		 257 aa  48.5  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0233946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1477  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 877 aa  48.5  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0939  glycosyl transferase family 2  30.33 
 
 		 391 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.334815  normal  0.709084 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5650  glycosyl transferase family protein  29.66 
 
 		 250 aa  48.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0347  glycosyl transferase family protein  28.3 
 
 		 260 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.740125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3100  glycosyl transferase family 2  28.21 
 
 		 247 aa  48.1  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0392  glycosyl transferase family 2  28.3 
 
 		 260 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0883  hypothetical protein  28.95 
 
 		 259 aa  47.8  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1409  glycosyl transferase family protein  28.91 
 
 		 585 aa  47.8  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0852  hypothetical protein  29.82 
 
 		 259 aa  47.4  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2078  glycosyl transferase family protein  26.35 
 
 		 255 aa  47.4  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149982  normal  0.0473511 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1206  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 		 521 aa  47.4  0.0007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.959652  normal  0.0123578 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0252  glycosyl transferase family 2  30.26 
 
 		 677 aa  47  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5052  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 		 897 aa  47  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00429729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0030  glycosyl transferase family 2  26.42 
 
 		 797 aa  47  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0565776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2331  glycosyl transferase family protein  28.28 
 
 		 250 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.839622  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2308  glycosyl transferase family protein  28.28 
 
 		 250 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1696  glycosyl transferase family protein  28.28 
 
 		 250 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792566  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0426  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 		 260 aa  46.6  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2202  glycosyl transferase protein  26.9 
 
 		 256 aa  46.2  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2023  glycosyl transferase family protein  36.19 
 
 		 385 aa  45.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00046  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  26.09 
 
 		 255 aa  45.8  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2347  glycosyl transferase family protein  32.69 
 
 		 250 aa  45.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0991  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  25.52 
 
 		 254 aa  45.1  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.87113  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4876  methyltransferase FkbM family  30.43 
 
 		 931 aa  44.7  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.541495  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8532  glycosyl transferase family 2  25.2 
 
 		 404 aa  44.3  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000714646 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2227  glycosyl transferase family protein  32.69 
 
 		 250 aa  44.7  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4045  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 		 285 aa  44.3  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.242236 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1446  glycosyl transferase family protein  31.52 
 
 		 280 aa  44.3  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0756  glycosyl transferase family protein  26.96 
 
 		 260 aa  44.3  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00258657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  27.48 
 
 		 1268 aa  44.3  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0850  glycosyl transferase family 2  23.72 
 
 		 265 aa  43.9  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.845126  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1812  glycosyl transferase family protein  24.56 
 
 		 875 aa  43.9  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.515485  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06130  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  25.62 
 
 		 252 aa  43.5  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.803849  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3480  glycosyl transferase family protein  22.28 
 
 		 261 aa  43.5  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0234  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  27.86 
 
 		 265 aa  43.5  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.284174  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0410  glycosyl transferase family 2  27.86 
 
 		 257 aa  43.5  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.562142  hitchhiker  0.000988056 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>