290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0177 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0177  membrane protein  100 
 
 
196 aa  369  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1527  protein of unknown function DUF205  36.36 
 
 
182 aa  93.2  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0309021  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0517  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  33.82 
 
 
202 aa  71.6  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0870487  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2305  hypothetical protein  38.94 
 
 
277 aa  68.9  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2278  hypothetical protein  41.12 
 
 
277 aa  68.2  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0740  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  34.95 
 
 
212 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0507  membrane protein  37.01 
 
 
194 aa  67  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0724  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  42.98 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4413  hypothetical protein  42.52 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0752  protein of unknown function DUF205  39.02 
 
 
202 aa  65.9  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0574  membrane protein  38.39 
 
 
193 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000985335  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07580  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  42.98 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0346741 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5082  protein of unknown function DUF205  35.95 
 
 
219 aa  65.1  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2823  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  33.66 
 
 
207 aa  64.7  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.571241 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf866  hypothetical protein  30.43 
 
 
220 aa  64.3  0.000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1982  membrane protein  30.77 
 
 
198 aa  63.9  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2417  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  33.17 
 
 
207 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0526  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.4 
 
 
210 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.888162  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1603  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.18 
 
 
198 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000195206 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3712  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.18 
 
 
198 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00759588  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0587  membrane protein  36.61 
 
 
193 aa  63.2  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00102729 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3624  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.32 
 
 
198 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000200164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3399  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.18 
 
 
198 aa  62.8  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000706679  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3361  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.18 
 
 
198 aa  62.8  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000818594  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3615  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.18 
 
 
198 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000137108 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3665  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.18 
 
 
198 aa  62.8  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000835645  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3630  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.32 
 
 
198 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000615777  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00854  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  33.16 
 
 
203 aa  62.8  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2253  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.53 
 
 
198 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000284506  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0051  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.88 
 
 
208 aa  62.8  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00859928  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3311  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.18 
 
 
198 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000228191  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0425  protein of unknown function DUF205  33.04 
 
 
195 aa  62.4  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493377  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3922  membrane protein  33.33 
 
 
195 aa  62.4  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0926824  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2553  hypothetical protein  44.14 
 
 
194 aa  62.4  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2109  protein of unknown function DUF205  35.62 
 
 
200 aa  62  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.119956  normal  0.406872 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2467  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  30.81 
 
 
189 aa  62  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3291  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.18 
 
 
198 aa  62  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000511628  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001618  acyl-phosphate:glycerol-3-phosphate O-acyltransferase PlsY  32.63 
 
 
203 aa  61.6  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0411697  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1788  membrane protein  40.52 
 
 
198 aa  61.6  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03451  membrane protein  40.57 
 
 
193 aa  61.6  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17280  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  30.49 
 
 
184 aa  61.2  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3095  protein of unknown function DUF205  38.84 
 
 
203 aa  61.2  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0484205  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1757  protein of unknown function DUF205  35.88 
 
 
198 aa  60.5  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1700  protein of unknown function DUF205  35.54 
 
 
204 aa  60.8  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.202165  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5952  protein of unknown function DUF205  36.8 
 
 
216 aa  61.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2329  hypothetical protein  34.59 
 
 
197 aa  60.8  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2693  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.32 
 
 
193 aa  60.1  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00164513  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1396  membrane protein  38.76 
 
 
216 aa  60.1  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0237  protein of unknown function DUF205  32.52 
 
 
208 aa  60.5  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2580  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  43.1 
 
 
208 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2695  hypothetical protein  34.97 
 
 
224 aa  60.5  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1945  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  43.1 
 
 
213 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.293753  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2556  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  43.1 
 
 
213 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477971  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4024  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.17 
 
 
192 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2295  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  30.77 
 
 
182 aa  59.3  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.57171  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5888  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.87 
 
 
212 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1594  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  39.64 
 
 
212 aa  59.7  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22068  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1078  hypothetical protein  38.21 
 
 
216 aa  59.3  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.243198  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2642  membrane protein  35.43 
 
 
198 aa  59.3  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2216  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  30.46 
 
 
186 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.268149  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2521  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  35.29 
 
 
203 aa  58.9  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.635021 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2604  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40 
 
 
212 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.740836  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2475  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40 
 
 
212 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0301507 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3209  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.8 
 
 
214 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468969  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0898  membrane protein  34.56 
 
 
198 aa  58.5  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4789  hypothetical protein  38.02 
 
 
226 aa  58.2  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.120033  normal  0.994064 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1070  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.1 
 
 
203 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2274  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  32.64 
 
 
182 aa  58.5  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.155164  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0914  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.1 
 
 
203 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17541  membrane protein  34.56 
 
 
198 aa  58.2  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0918  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.1 
 
 
203 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0530373  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2581  membrane protein  34.01 
 
 
235 aa  58.2  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1955  membrane protein  34.27 
 
 
219 aa  57.8  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0878963  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2470  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.93 
 
 
205 aa  58.2  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0651  membrane protein  33.85 
 
 
196 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.623909  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2952  membrane protein  34.65 
 
 
194 aa  57.8  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.71102  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3272  protein of unknown function DUF205  33.33 
 
 
217 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0827  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.62 
 
 
210 aa  57  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0696875  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5145  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  32.62 
 
 
189 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.479047 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1178  hypothetical protein  37.21 
 
 
216 aa  56.6  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0753  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.8 
 
 
214 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1043  hypothetical protein  33.12 
 
 
200 aa  56.6  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000725883  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2827  protein of unknown function DUF205  33.33 
 
 
217 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4343  membrane protein  37.6 
 
 
203 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.213593  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3411  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.74 
 
 
211 aa  56.6  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0338117  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0171  hypothetical protein  37.61 
 
 
198 aa  56.6  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0793  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.68 
 
 
213 aa  56.2  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.414497  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2546  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  32.5 
 
 
207 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0372  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.3 
 
 
203 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_8  hypothetical protein  38.94 
 
 
212 aa  56.2  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0672  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.3 
 
 
203 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0121  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.3 
 
 
203 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0729  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.6 
 
 
202 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1592  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  35.59 
 
 
197 aa  56.2  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.827594  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1111  hypothetical protein  33.61 
 
 
212 aa  56.2  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2507  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.3 
 
 
203 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2989  hypothetical protein  36.75 
 
 
198 aa  55.5  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4637  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  33.51 
 
 
192 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.481632 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0155  protein of unknown function DUF205  36.15 
 
 
208 aa  55.8  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.337449 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0008  membrane protein  34.69 
 
 
200 aa  55.8  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>