15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2155 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2155  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  384  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000244584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3316  hypothetical protein  28.72 
 
 		 177 aa  67.4  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1743  hypothetical protein  27.18 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2200  hypothetical protein  25.52 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00305441  hitchhiker  0.00000000556754 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  68.75 
 
 		 2914 aa  48.1  0.00008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1346  hypothetical protein  25.81 
 
 		 187 aa  47.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4827  hypothetical protein  28.82 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.788125  normal  0.10965 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3908  MerR family transcriptional regulator  44 
 
 		 629 aa  45.4  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0836  hypothetical protein  27.37 
 
 		 192 aa  43.9  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3163  hypothetical protein  44.44 
 
 		 857 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  59.38 
 
 		 2851 aa  42.4  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3503  hypothetical protein  54.29 
 
 		 311 aa  41.6  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000360551  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1681  hypothetical protein  52.78 
 
 		 953 aa  42  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1289  triple helix repeat-containing collagen  71.43 
 
 		 309 aa  41.2  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.577985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  66.67 
 
 		 438 aa  41.2  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>