25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0836 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0836  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  391  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1743  hypothetical protein  44.97 
 
 		 192 aa  157  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2200  hypothetical protein  37.43 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00305441  hitchhiker  0.00000000556754 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3316  hypothetical protein  33.33 
 
 		 177 aa  101  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1346  hypothetical protein  35.32 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2155  hypothetical protein  30.41 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000244584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  56.25 
 
 		 400 aa  52  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4540  hypothetical protein  25.68 
 
 		 177 aa  47.8  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  67.86 
 
 		 1426 aa  46.2  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3449  Collagen triple helix repeat protein  60 
 
 		 663 aa  45.4  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344079  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  70.97 
 
 		 451 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  70.97 
 
 		 437 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  70.97 
 
 		 437 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  70.97 
 
 		 434 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2393  hypothetical protein  62.86 
 
 		 307 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.535773  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1338  group-specific protein  67.74 
 
 		 436 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00783091  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  70.97 
 
 		 439 aa  43.1  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  70.97 
 
 		 437 aa  43.1  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2610  Collagen triple helix repeat protein  57.58 
 
 		 767 aa  42.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.965964  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1681  hypothetical protein  61.11 
 
 		 953 aa  42.4  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  56.76 
 
 		 2914 aa  42  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  64.52 
 
 		 438 aa  41.6  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5445  LmbE family protein  64 
 
 		 1071 aa  41.6  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03288  putative alkaline phosphatase  44.44 
 
 		 600 aa  41.2  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  70.97 
 
 		 645 aa  41.2  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>