More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1842 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1842  hypothetical protein  100 
 
 
265 aa  556  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00098228  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0397  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  69.76 
 
 
253 aa  380  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110974 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1375  hypothetical protein  68.8 
 
 
250 aa  379  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.267748  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0752  hypothetical protein  54.22 
 
 
274 aa  285  7e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.195276 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43080  hypothetical protein  51.41 
 
 
274 aa  277  1e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1413  hypothetical protein  54.32 
 
 
249 aa  276  3e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.170159  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1715  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  51.79 
 
 
277 aa  268  5.9999999999999995e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0071  hypothetical protein  48.15 
 
 
246 aa  264  1e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0112  hypothetical protein  48.15 
 
 
246 aa  263  2e-69  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0086  hypothetical protein  48.15 
 
 
245 aa  262  4e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0364  hypothetical protein  48.79 
 
 
275 aa  261  6.999999999999999e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.228325  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1766  hypothetical protein  52.19 
 
 
260 aa  256  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0884  hypothetical protein  50 
 
 
244 aa  256  4e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1454  cysteine-rich domain protein  46.5 
 
 
245 aa  254  8e-67  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00283589  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4689  hypothetical protein  49.8 
 
 
261 aa  249  5e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1421  cysteine-rich domain-containing protein  46.4 
 
 
250 aa  246  2e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5899  hypothetical protein  48.58 
 
 
261 aa  240  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5448  hypothetical protein  47.86 
 
 
259 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.950541  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5378  hypothetical protein  47.77 
 
 
264 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441128  normal  0.860708 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2670  hypothetical protein  48.98 
 
 
266 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2803  hypothetical protein  48.16 
 
 
266 aa  238  8e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.632072  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0201  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich protein  45.63 
 
 
267 aa  236  2e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6081  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  47.15 
 
 
266 aa  236  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0717  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.98 
 
 
248 aa  210  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3164  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.62 
 
 
256 aa  206  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0367  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  41.49 
 
 
259 aa  202  6e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1769  hypothetical protein  44.68 
 
 
266 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.329693  normal  0.0772008 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0140  hypothetical protein  41.7 
 
 
263 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0392  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.25 
 
 
238 aa  193  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2958  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  39.15 
 
 
242 aa  189  5e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3263  hypothetical protein  39.15 
 
 
242 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1274  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.77 
 
 
239 aa  188  9e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3037  hypothetical protein  38.72 
 
 
242 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.291586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3270  hypothetical protein  38.72 
 
 
242 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1896  Fe-S oxidoreductase  39.75 
 
 
256 aa  185  5e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.138109  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0967  hypothetical protein  40 
 
 
245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1611  hypothetical protein  41.95 
 
 
241 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0746419  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2995  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  38.98 
 
 
246 aa  181  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1905  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.8 
 
 
245 aa  181  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1216  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.66 
 
 
244 aa  181  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.770234  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3259  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.42 
 
 
240 aa  180  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3730  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.92 
 
 
249 aa  180  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0542099  normal  0.363647 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2593  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.57 
 
 
270 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.128565  normal  0.0827191 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2718  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.57 
 
 
247 aa  179  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1206  hypothetical protein  39.91 
 
 
241 aa  179  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.546437  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5226  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.66 
 
 
249 aa  179  4.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0079  hypothetical protein  37.55 
 
 
260 aa  179  4.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.376514  unclonable  0.0000154463 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1310  hypothetical protein  41 
 
 
241 aa  178  8e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37080  Fe-S oxidoreductase  39.74 
 
 
243 aa  178  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.151092  normal  0.0205493 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4458  hypothetical protein  39.58 
 
 
247 aa  176  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.169961 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1547  hypothetical protein  40.25 
 
 
240 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198081  normal  0.0351499 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7370  cysteine-rich domain protein  37.65 
 
 
250 aa  176  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660622  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2222  hypothetical protein  41.1 
 
 
263 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0810  hypothetical protein  37.94 
 
 
249 aa  176  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0233285 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2738  Fe-S oxidoreductase  41.1 
 
 
240 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2604  hypothetical protein  41.1 
 
 
240 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.186656  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4815  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.55 
 
 
247 aa  175  5e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1713  hypothetical protein  41.1 
 
 
240 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.8421  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3098  hypothetical protein  41.1 
 
 
240 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00812964  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2660  hypothetical protein  41.1 
 
 
240 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1935  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.1 
 
 
241 aa  175  5e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.0152527 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1494  hypothetical protein  41.1 
 
 
240 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3563  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.83 
 
 
249 aa  175  6e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0102494  hitchhiker  0.00479184 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2452  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  40 
 
 
247 aa  175  6e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.345477  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2585  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.25 
 
 
240 aa  175  8e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.749181  hitchhiker  0.00208948 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1607  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.59 
 
 
241 aa  175  8e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.096074  normal  0.366344 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3243  hypothetical protein  41.03 
 
 
234 aa  174  9e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.496148  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3038  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.24 
 
 
246 aa  175  9e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1464  hypothetical protein  41.1 
 
 
240 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.270606  normal  0.902058 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1870  hypothetical protein  41.1 
 
 
240 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214075  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2926  hypothetical protein  38.43 
 
 
256 aa  174  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0345775  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3606  hypothetical protein  38.72 
 
 
270 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1431  hypothetical protein  37.13 
 
 
268 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.667811  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0867  hypothetical protein  37.13 
 
 
268 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.258503  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0458  hypothetical protein  37.13 
 
 
268 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2182  hypothetical protein  37.13 
 
 
268 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1873  hypothetical protein  37.13 
 
 
289 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2080  hypothetical protein  37.55 
 
 
268 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.945675  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1034  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.83 
 
 
249 aa  171  7.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.92586  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2148  hypothetical protein  40.25 
 
 
240 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11459  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1024  hypothetical protein  38.33 
 
 
239 aa  171  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0555  Fe-S oxidoreductase  37.13 
 
 
268 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3104  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.93 
 
 
267 aa  170  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2041  hypothetical protein  39.83 
 
 
240 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.914482  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5946  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  39.83 
 
 
240 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0860628  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1437  hypothetical protein  38.21 
 
 
247 aa  169  5e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2282  hypothetical protein  42.86 
 
 
260 aa  169  5e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.293484  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2131  hypothetical protein  39.83 
 
 
240 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198327  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0560  hypothetical protein  42.98 
 
 
265 aa  169  5e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.221453  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1397  hypothetical protein  39.32 
 
 
262 aa  169  6e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0375  hypothetical protein  38.02 
 
 
289 aa  168  7e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000724873  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2168  hypothetical protein  39.83 
 
 
240 aa  168  7e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2429  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.04 
 
 
248 aa  168  8e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267816 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4766  hypothetical protein  37.82 
 
 
251 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04070  Fe-S oxidoreductase  38.46 
 
 
244 aa  167  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0880878 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4385  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  37.82 
 
 
251 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1392  hypothetical protein  36.97 
 
 
239 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4472  hypothetical protein  37.82 
 
 
251 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.783879 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1416  hypothetical protein  36.97 
 
 
239 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1456  hypothetical protein  36.97 
 
 
239 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>