More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0752 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0752  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195276 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43080  hypothetical protein  81.32 
 
 		 274 aa  471  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1715  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  74.91 
 
 		 277 aa  417  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0364  hypothetical protein  70.59 
 
 		 275 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.228325  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2803  hypothetical protein  57.65 
 
 		 266 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.632072  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4689  hypothetical protein  56.8 
 
 		 261 aa  303  2.0000000000000002e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2670  hypothetical protein  57.25 
 
 		 266 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1421  cysteine-rich domain-containing protein  57.6 
 
 		 250 aa  303  2.0000000000000002e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6081  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  57.25 
 
 		 266 aa  298  5e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1766  hypothetical protein  58.27 
 
 		 260 aa  297  1e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5899  hypothetical protein  56.76 
 
 		 261 aa  295  6e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5448  hypothetical protein  56.47 
 
 		 259 aa  294  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.950541  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5378  hypothetical protein  54.8 
 
 		 264 aa  290  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441128  normal  0.860708 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0201  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich protein  54.05 
 
 		 267 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1375  hypothetical protein  53.01 
 
 		 250 aa  278  5e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.267748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0397  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  51.41 
 
 		 253 aa  275  8e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110974 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1842  hypothetical protein  54.22 
 
 		 265 aa  271  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00098228  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1413  hypothetical protein  53.72 
 
 		 249 aa  266  2e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.170159  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0071  hypothetical protein  42.39 
 
 		 246 aa  223  2e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0086  hypothetical protein  42.39 
 
 		 245 aa  223  2e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0112  hypothetical protein  42.39 
 
 		 246 aa  222  4e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1454  cysteine-rich domain protein  42.56 
 
 		 245 aa  219  5e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00283589  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0717  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  45.87 
 
 		 248 aa  209  4e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0884  hypothetical protein  40.5 
 
 		 244 aa  205  5e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3164  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.9 
 
 		 256 aa  199  3e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0140  hypothetical protein  42.92 
 
 		 263 aa  198  7e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0392  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.18 
 
 		 238 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1935  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  45.34 
 
 		 241 aa  193  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.0152527 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1607  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.92 
 
 		 241 aa  193  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.096074  normal  0.366344 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1611  hypothetical protein  44.49 
 
 		 241 aa  192  5e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0746419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0967  hypothetical protein  40.93 
 
 		 245 aa  191  9e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1310  hypothetical protein  44.49 
 
 		 241 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1206  hypothetical protein  43.64 
 
 		 241 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.546437  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2222  hypothetical protein  44.08 
 
 		 263 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0079  hypothetical protein  39.66 
 
 		 260 aa  189  4e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.376514  unclonable  0.0000154463 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2585  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.92 
 
 		 240 aa  187  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.749181  hitchhiker  0.00208948 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1274  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.7 
 
 		 239 aa  186  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0367  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  40.17 
 
 		 259 aa  186  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2958  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  37.87 
 
 		 242 aa  186  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3263  hypothetical protein  37.45 
 
 		 242 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2660  hypothetical protein  44.92 
 
 		 240 aa  185  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2604  hypothetical protein  44.92 
 
 		 240 aa  185  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.186656  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1713  hypothetical protein  44.92 
 
 		 240 aa  185  6e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.8421  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1494  hypothetical protein  44.92 
 
 		 240 aa  185  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3098  hypothetical protein  44.92 
 
 		 240 aa  185  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00812964  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2738  Fe-S oxidoreductase  44.92 
 
 		 240 aa  185  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3037  hypothetical protein  37.02 
 
 		 242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.291586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3270  hypothetical protein  37.02 
 
 		 242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1547  hypothetical protein  43.64 
 
 		 240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198081  normal  0.0351499 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1464  hypothetical protein  44.07 
 
 		 240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.270606  normal  0.902058 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1769  hypothetical protein  40.96 
 
 		 266 aa  183  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.329693  normal  0.0772008 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3259  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.24 
 
 		 240 aa  183  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1024  hypothetical protein  39.42 
 
 		 239 aa  182  6e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1870  hypothetical protein  44.49 
 
 		 240 aa  182  6e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214075  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2995  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  39.67 
 
 		 246 aa  181  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1354  hypothetical protein  38.08 
 
 		 239 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1216  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.39 
 
 		 244 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.770234  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1416  hypothetical protein  38.08 
 
 		 239 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1216  hypothetical protein  38.08 
 
 		 239 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0407054  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1194  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  38.08 
 
 		 239 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1196  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  38.08 
 
 		 239 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0498426  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1315  hypothetical protein  38.08 
 
 		 239 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1456  hypothetical protein  38.08 
 
 		 239 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1218  hypothetical protein  38.08 
 
 		 239 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3990  hypothetical protein  37.66 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.441671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0818  hypothetical protein  39 
 
 		 241 aa  177  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.212327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2148  hypothetical protein  44.07 
 
 		 240 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2041  hypothetical protein  43.64 
 
 		 240 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.914482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1392  hypothetical protein  37.66 
 
 		 239 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2168  hypothetical protein  43.64 
 
 		 240 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1096  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.34 
 
 		 249 aa  177  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.757675 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1139  hypothetical protein  43.35 
 
 		 236 aa  176  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.79138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1690  glycolate oxidase-like protein  39.83 
 
 		 274 aa  176  5e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5437  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  42.44 
 
 		 240 aa  175  7e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3589  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.49 
 
 		 265 aa  174  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5946  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  43.22 
 
 		 240 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0860628  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2131  hypothetical protein  43.22 
 
 		 240 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198327  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2593  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.28 
 
 		 270 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.128565  normal  0.0827191 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0555  Fe-S oxidoreductase  40.08 
 
 		 268 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3606  hypothetical protein  40.85 
 
 		 270 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2080  hypothetical protein  40.08 
 
 		 268 aa  171  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.945675  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0867  hypothetical protein  40.08 
 
 		 268 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.258503  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1431  hypothetical protein  40.08 
 
 		 268 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.667811  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1873  hypothetical protein  40.08 
 
 		 289 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0458  hypothetical protein  40.08 
 
 		 268 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2182  hypothetical protein  40.08 
 
 		 268 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37080  Fe-S oxidoreductase  37.87 
 
 		 243 aa  169  6e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.151092  normal  0.0205493 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2926  hypothetical protein  39.68 
 
 		 256 aa  168  9e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0345775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1896  Fe-S oxidoreductase  37.82 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.138109  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0560  hypothetical protein  43.4 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.221453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1397  hypothetical protein  38.52 
 
 		 262 aa  167  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3243  hypothetical protein  40.34 
 
 		 234 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.496148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7370  cysteine-rich domain protein  38.84 
 
 		 250 aa  165  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2709  hypothetical protein  37.55 
 
 		 248 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.270424  normal  0.129266 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4815  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.49 
 
 		 247 aa  163  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1905  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.6 
 
 		 245 aa  162  7e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2718  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.87 
 
 		 247 aa  161  9e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2429  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40 
 
 		 248 aa  161  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267816 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0375  hypothetical protein  35.71 
 
 		 289 aa  159  4e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000724873  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3622  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.51 
 
 		 257 aa  159  5e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>