More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2585 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2585  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  100 
 
 
240 aa  490  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.749181  hitchhiker  0.00208948 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1547  hypothetical protein  96.25 
 
 
240 aa  476  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198081  normal  0.0351499 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1464  hypothetical protein  89.12 
 
 
240 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.270606  normal  0.902058 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2168  hypothetical protein  86.25 
 
 
240 aa  431  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2041  hypothetical protein  85.83 
 
 
240 aa  431  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.914482  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5437  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  85.42 
 
 
240 aa  430  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135566  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2222  hypothetical protein  85 
 
 
263 aa  424  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2148  hypothetical protein  85 
 
 
240 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11459  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1713  hypothetical protein  85 
 
 
240 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.8421  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1139  hypothetical protein  85.59 
 
 
236 aa  422  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.79138  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2604  hypothetical protein  85 
 
 
240 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.186656  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1870  hypothetical protein  84.58 
 
 
240 aa  421  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214075  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3098  hypothetical protein  85 
 
 
240 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00812964  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2660  hypothetical protein  85 
 
 
240 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5946  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  84.17 
 
 
240 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0860628  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2131  hypothetical protein  84.17 
 
 
240 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198327  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1494  hypothetical protein  85 
 
 
240 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2738  Fe-S oxidoreductase  84.58 
 
 
240 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1310  hypothetical protein  80 
 
 
241 aa  394  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1206  hypothetical protein  79.58 
 
 
241 aa  392  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.546437  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1607  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  78.33 
 
 
241 aa  387  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.096074  normal  0.366344 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1611  hypothetical protein  78.33 
 
 
241 aa  385  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0746419  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1935  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  78.33 
 
 
241 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.0152527 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1769  hypothetical protein  60.08 
 
 
266 aa  283  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.329693  normal  0.0772008 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0669  hypothetical protein  59.83 
 
 
243 aa  279  3e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0954341  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0367  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  56.67 
 
 
259 aa  273  1.0000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2080  hypothetical protein  56.67 
 
 
268 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.945675  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3164  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  54.2 
 
 
256 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1873  hypothetical protein  56.2 
 
 
289 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1431  hypothetical protein  56.2 
 
 
268 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.667811  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2182  hypothetical protein  56.2 
 
 
268 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0458  hypothetical protein  56.2 
 
 
268 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0867  hypothetical protein  56.2 
 
 
268 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.258503  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0555  Fe-S oxidoreductase  55.83 
 
 
268 aa  250  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0140  hypothetical protein  55.04 
 
 
263 aa  248  8e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1690  glycolate oxidase-like protein  49.16 
 
 
274 aa  238  5.999999999999999e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1216  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  50.63 
 
 
244 aa  237  1e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.770234  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2926  hypothetical protein  52.32 
 
 
256 aa  231  7.000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0345775  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0560  hypothetical protein  55.46 
 
 
265 aa  231  9e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.221453  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3606  hypothetical protein  50.42 
 
 
270 aa  228  4e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3589  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  52.52 
 
 
265 aa  228  8e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2429  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  51.88 
 
 
248 aa  226  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267816 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2958  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  43.7 
 
 
242 aa  218  5e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3263  hypothetical protein  43.28 
 
 
242 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0079  hypothetical protein  48.94 
 
 
260 aa  218  7.999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.376514  unclonable  0.0000154463 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2282  hypothetical protein  52.92 
 
 
260 aa  217  1e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.293484  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3037  hypothetical protein  42.86 
 
 
242 aa  216  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.291586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3270  hypothetical protein  42.86 
 
 
242 aa  216  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5452  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.12 
 
 
239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.625319 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1905  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.84 
 
 
245 aa  211  7.999999999999999e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0717  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  46.86 
 
 
248 aa  206  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1274  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  46.84 
 
 
239 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1024  hypothetical protein  43.88 
 
 
239 aa  202  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3990  hypothetical protein  42.62 
 
 
239 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.441671  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0392  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.73 
 
 
238 aa  198  7.999999999999999e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1354  hypothetical protein  42.62 
 
 
239 aa  197  9e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1218  hypothetical protein  42.62 
 
 
239 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1416  hypothetical protein  42.62 
 
 
239 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1216  hypothetical protein  42.62 
 
 
239 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0407054  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1194  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  42.62 
 
 
239 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1196  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  42.62 
 
 
239 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0498426  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1456  hypothetical protein  42.62 
 
 
239 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1315  hypothetical protein  42.62 
 
 
239 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2722  hypothetical protein  41.8 
 
 
242 aa  195  7e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.451695  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1392  hypothetical protein  42.19 
 
 
239 aa  193  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1437  oxidoreductase  42.26 
 
 
246 aa  192  6e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.147364  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43080  hypothetical protein  44.64 
 
 
274 aa  191  7e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0397  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.5 
 
 
253 aa  191  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110974 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1715  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.68 
 
 
277 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0752  hypothetical protein  44.92 
 
 
274 aa  187  9e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.195276 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2995  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  43.93 
 
 
246 aa  187  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1375  hypothetical protein  41.53 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.267748  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1413  hypothetical protein  42.13 
 
 
249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.170159  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1096  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.73 
 
 
249 aa  181  7e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.757675 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5378  hypothetical protein  43.04 
 
 
264 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441128  normal  0.860708 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2718  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.33 
 
 
247 aa  181  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3259  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.66 
 
 
240 aa  181  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0364  hypothetical protein  42.13 
 
 
275 aa  181  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.228325  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0201  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich protein  44.74 
 
 
267 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2593  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.6 
 
 
270 aa  179  4.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.128565  normal  0.0827191 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6081  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  44.35 
 
 
266 aa  178  7e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5448  hypothetical protein  42.5 
 
 
259 aa  178  9e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.950541  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1421  cysteine-rich domain-containing protein  40.51 
 
 
250 aa  176  3e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3243  hypothetical protein  42.68 
 
 
234 aa  176  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.496148  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5899  hypothetical protein  42.98 
 
 
261 aa  176  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4689  hypothetical protein  42.8 
 
 
261 aa  174  8e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12950  Fe-S oxidoreductase  41.87 
 
 
261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0443672  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0818  hypothetical protein  40.27 
 
 
241 aa  173  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.212327  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2803  hypothetical protein  42.8 
 
 
266 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.632072  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0967  hypothetical protein  39.83 
 
 
245 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2670  hypothetical protein  42.8 
 
 
266 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3038  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.66 
 
 
246 aa  171  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1896  Fe-S oxidoreductase  38.84 
 
 
256 aa  170  2e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.138109  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2452  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  40.25 
 
 
247 aa  169  5e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.345477  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1766  hypothetical protein  44.75 
 
 
260 aa  168  6e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1842  hypothetical protein  40.25 
 
 
265 aa  168  6e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00098228  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1749  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.34 
 
 
239 aa  168  8e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0856492  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4458  hypothetical protein  40.42 
 
 
247 aa  167  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.169961 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37080  Fe-S oxidoreductase  39.75 
 
 
243 aa  164  9e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.151092  normal  0.0205493 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4815  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39 
 
 
247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>