More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0560 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0560  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  545  1e-154  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.221453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2429  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  73.17 
 
 		 248 aa  345  3e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267816 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2926  hypothetical protein  68.15 
 
 		 256 aa  340  1e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0345775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0367  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  60.55 
 
 		 259 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1769  hypothetical protein  62.5 
 
 		 266 aa  326  2.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.329693  normal  0.0772008 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3589  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  63.88 
 
 		 265 aa  323  2e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3164  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  59.84 
 
 		 256 aa  316  2e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1690  glycolate oxidase-like protein  58.5 
 
 		 274 aa  301  1e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0140  hypothetical protein  58.94 
 
 		 263 aa  298  8e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1431  hypothetical protein  57.2 
 
 		 268 aa  295  7e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.667811  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1873  hypothetical protein  57.2 
 
 		 289 aa  295  7e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2182  hypothetical protein  57.2 
 
 		 268 aa  295  7e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0867  hypothetical protein  57.2 
 
 		 268 aa  295  7e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.258503  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0458  hypothetical protein  57.2 
 
 		 268 aa  295  7e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0555  Fe-S oxidoreductase  56.8 
 
 		 268 aa  292  3e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2080  hypothetical protein  54.34 
 
 		 268 aa  290  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.945675  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2282  hypothetical protein  60.4 
 
 		 260 aa  279  4e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.293484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3606  hypothetical protein  54.33 
 
 		 270 aa  276  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1611  hypothetical protein  57.14 
 
 		 241 aa  268  8.999999999999999e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0746419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1935  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  57.14 
 
 		 241 aa  266  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.0152527 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1607  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  57.14 
 
 		 241 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.096074  normal  0.366344 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0392  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  52.56 
 
 		 238 aa  256  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1206  hypothetical protein  53.78 
 
 		 241 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.546437  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1274  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  52.99 
 
 		 239 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2222  hypothetical protein  53.33 
 
 		 263 aa  252  3e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2738  Fe-S oxidoreductase  55.46 
 
 		 240 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1713  hypothetical protein  55.46 
 
 		 240 aa  250  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.8421  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1310  hypothetical protein  54.2 
 
 		 241 aa  250  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1494  hypothetical protein  55.46 
 
 		 240 aa  250  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2604  hypothetical protein  55.46 
 
 		 240 aa  250  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.186656  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3098  hypothetical protein  55.46 
 
 		 240 aa  250  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00812964  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2660  hypothetical protein  55.46 
 
 		 240 aa  250  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2585  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  55.46 
 
 		 240 aa  247  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.749181  hitchhiker  0.00208948 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1870  hypothetical protein  54.62 
 
 		 240 aa  247  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214075  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1547  hypothetical protein  54.2 
 
 		 240 aa  245  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198081  normal  0.0351499 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1464  hypothetical protein  54.62 
 
 		 240 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.270606  normal  0.902058 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1024  hypothetical protein  47.44 
 
 		 239 aa  241  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2148  hypothetical protein  52.94 
 
 		 240 aa  236  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11459  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2958  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  47.03 
 
 		 242 aa  237  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2041  hypothetical protein  52.94 
 
 		 240 aa  236  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.914482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3263  hypothetical protein  46.61 
 
 		 242 aa  236  3e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0669  hypothetical protein  51.87 
 
 		 243 aa  236  3e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0954341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2168  hypothetical protein  52.94 
 
 		 240 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3990  hypothetical protein  46.58 
 
 		 239 aa  236  3e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.441671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1354  hypothetical protein  46.58 
 
 		 239 aa  235  6e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3037  hypothetical protein  46.19 
 
 		 242 aa  234  9e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.291586  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1218  hypothetical protein  47.01 
 
 		 239 aa  234  9e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3270  hypothetical protein  46.19 
 
 		 242 aa  234  9e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5437  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  52.1 
 
 		 240 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1392  hypothetical protein  46.58 
 
 		 239 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1139  hypothetical protein  52.77 
 
 		 236 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.79138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1456  hypothetical protein  46.58 
 
 		 239 aa  233  3e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1416  hypothetical protein  46.58 
 
 		 239 aa  233  3e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1216  hypothetical protein  46.58 
 
 		 239 aa  233  3e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0407054  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1194  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  46.58 
 
 		 239 aa  233  3e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1196  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  46.58 
 
 		 239 aa  233  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0498426  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1315  hypothetical protein  46.58 
 
 		 239 aa  233  3e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5946  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  52.1 
 
 		 240 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0860628  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2131  hypothetical protein  52.1 
 
 		 240 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198327  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0967  hypothetical protein  44.68 
 
 		 245 aa  223  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1896  Fe-S oxidoreductase  47.88 
 
 		 256 aa  223  3e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.138109  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0717  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  49.15 
 
 		 248 aa  221  7e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1216  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  45.99 
 
 		 244 aa  217  1e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.770234  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0079  hypothetical protein  43.57 
 
 		 260 aa  209  3e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.376514  unclonable  0.0000154463 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1749  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.68 
 
 		 239 aa  209  5e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0856492  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2677  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.4 
 
 		 239 aa  204  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0338  hypothetical protein  42.55 
 
 		 239 aa  203  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0359  cysteine-rich domain protein  42.74 
 
 		 239 aa  202  4e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.477523 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0359  hypothetical protein  42.74 
 
 		 239 aa  202  5e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.368337  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0321  hypothetical protein  42.74 
 
 		 239 aa  202  5e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3259  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.28 
 
 		 240 aa  202  7e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0259  cysteine-rich domain protein  42.74 
 
 		 239 aa  201  7e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0375  hypothetical protein  42.02 
 
 		 289 aa  201  9e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000724873  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2718  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  45.87 
 
 		 247 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00262  predicted oxidoreductase  42.31 
 
 		 239 aa  199  3e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3299  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.31 
 
 		 239 aa  199  3e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00266  hypothetical protein  42.31 
 
 		 239 aa  199  3e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2995  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  43.46 
 
 		 246 aa  199  3e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37080  Fe-S oxidoreductase  43.9 
 
 		 243 aa  199  6e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.151092  normal  0.0205493 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12950  Fe-S oxidoreductase  41.9 
 
 		 261 aa  198  7.999999999999999e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0443672  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3316  hypothetical protein  41.88 
 
 		 239 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0709  hypothetical protein  40.25 
 
 		 243 aa  194  2e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.162619  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5452  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.87 
 
 		 239 aa  190  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.625319 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3038  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.17 
 
 		 246 aa  189  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1905  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.55 
 
 		 245 aa  189  4e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1766  hypothetical protein  43.16 
 
 		 260 aa  185  5e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1234  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.98 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.399981  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3704  hypothetical protein  42.98 
 
 		 246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.475833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7370  cysteine-rich domain protein  42.39 
 
 		 250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0397  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.28 
 
 		 253 aa  183  3e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110974 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4458  hypothetical protein  43.64 
 
 		 247 aa  183  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.169961 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2768  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.55 
 
 		 239 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2722  hypothetical protein  37.87 
 
 		 242 aa  182  4.0000000000000006e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.451695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2452  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  42.44 
 
 		 247 aa  182  4.0000000000000006e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.345477  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0752  hypothetical protein  43.4 
 
 		 274 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195276 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2593  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.22 
 
 		 270 aa  182  6e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.128565  normal  0.0827191 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1096  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.2 
 
 		 249 aa  181  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.757675 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05530  Fe-S oxidoreductase  37.45 
 
 		 248 aa  180  2e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0810  hypothetical protein  44.64 
 
 		 249 aa  180  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0233285 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43080  hypothetical protein  43.53 
 
 		 274 aa  180  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>