More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2995 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2995  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  100 
 
 
246 aa  494  1e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0079  hypothetical protein  51.69 
 
 
260 aa  245  4.9999999999999997e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.376514  unclonable  0.0000154463 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2958  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  46.64 
 
 
242 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3263  hypothetical protein  46.22 
 
 
242 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0967  hypothetical protein  46.53 
 
 
245 aa  233  3e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3037  hypothetical protein  45.8 
 
 
242 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.291586  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0392  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  47.3 
 
 
238 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3270  hypothetical protein  45.8 
 
 
242 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0717  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  50.81 
 
 
248 aa  229  2e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2722  hypothetical protein  47.72 
 
 
242 aa  230  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.451695  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3990  hypothetical protein  45.64 
 
 
239 aa  227  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.441671  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1354  hypothetical protein  45.64 
 
 
239 aa  226  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1024  hypothetical protein  45.23 
 
 
239 aa  226  3e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1392  hypothetical protein  45.23 
 
 
239 aa  224  8e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1456  hypothetical protein  45.23 
 
 
239 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1416  hypothetical protein  45.23 
 
 
239 aa  224  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1216  hypothetical protein  45.23 
 
 
239 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0407054  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1194  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  45.23 
 
 
239 aa  224  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1196  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  45.23 
 
 
239 aa  224  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0498426  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1315  hypothetical protein  45.23 
 
 
239 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1096  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  49.37 
 
 
249 aa  223  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.757675 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1274  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  45.87 
 
 
239 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0818  hypothetical protein  48.12 
 
 
241 aa  221  8e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.212327  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1218  hypothetical protein  44.81 
 
 
239 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5452  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  46.22 
 
 
239 aa  217  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.625319 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1216  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  45.99 
 
 
244 aa  215  5e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.770234  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1206  hypothetical protein  48.12 
 
 
241 aa  211  7e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.546437  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1611  hypothetical protein  47.28 
 
 
241 aa  211  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0746419  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3259  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.02 
 
 
240 aa  210  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1935  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  47.28 
 
 
241 aa  210  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.0152527 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1607  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  47.28 
 
 
241 aa  209  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.096074  normal  0.366344 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1310  hypothetical protein  47.7 
 
 
241 aa  209  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1905  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.6 
 
 
245 aa  207  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37080  Fe-S oxidoreductase  44.73 
 
 
243 aa  201  9e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.151092  normal  0.0205493 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7370  cysteine-rich domain protein  45.53 
 
 
250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660622  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0338  hypothetical protein  42.32 
 
 
239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0359  cysteine-rich domain protein  42.32 
 
 
239 aa  199  3e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.477523 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1896  Fe-S oxidoreductase  42.5 
 
 
256 aa  199  3e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.138109  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0321  hypothetical protein  42.32 
 
 
239 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0359  hypothetical protein  42.32 
 
 
239 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.368337  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0259  cysteine-rich domain protein  42.32 
 
 
239 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1437  oxidoreductase  43.4 
 
 
246 aa  199  5e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.147364  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05530  Fe-S oxidoreductase  40.89 
 
 
248 aa  198  6e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1749  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.49 
 
 
239 aa  197  9e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0856492  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00262  predicted oxidoreductase  41.91 
 
 
239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3299  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.91 
 
 
239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00266  hypothetical protein  41.91 
 
 
239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2148  hypothetical protein  46.44 
 
 
240 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11459  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3038  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.58 
 
 
246 aa  195  5.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3704  hypothetical protein  45.27 
 
 
246 aa  194  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.475833  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5946  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  46.03 
 
 
240 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0860628  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0367  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  40.93 
 
 
259 aa  194  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2131  hypothetical protein  46.03 
 
 
240 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198327  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0140  hypothetical protein  41.8 
 
 
263 aa  194  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3316  hypothetical protein  41.49 
 
 
239 aa  194  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4815  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.75 
 
 
247 aa  194  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2677  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.08 
 
 
239 aa  193  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2709  hypothetical protein  44.67 
 
 
248 aa  192  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.270424  normal  0.129266 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2041  hypothetical protein  45.61 
 
 
240 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.914482  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0375  hypothetical protein  39.83 
 
 
289 aa  192  5e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000724873  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2593  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.96 
 
 
270 aa  191  7e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.128565  normal  0.0827191 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3164  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.77 
 
 
256 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5437  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  44.77 
 
 
240 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135566  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1234  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.49 
 
 
239 aa  191  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.399981  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1769  hypothetical protein  42.62 
 
 
266 aa  190  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.329693  normal  0.0772008 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3606  hypothetical protein  44.73 
 
 
270 aa  190  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2768  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.15 
 
 
239 aa  190  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2926  hypothetical protein  41.77 
 
 
256 aa  190  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0345775  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0555  Fe-S oxidoreductase  42.26 
 
 
268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0458  hypothetical protein  42.26 
 
 
268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1431  hypothetical protein  42.26 
 
 
268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.667811  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1873  hypothetical protein  42.26 
 
 
289 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2182  hypothetical protein  42.26 
 
 
268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0867  hypothetical protein  42.26 
 
 
268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.258503  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2168  hypothetical protein  45.19 
 
 
240 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4922  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.56 
 
 
246 aa  189  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00884029  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1139  hypothetical protein  45.11 
 
 
236 aa  189  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.79138  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4766  hypothetical protein  42.92 
 
 
251 aa  188  5e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4385  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  42.92 
 
 
251 aa  188  5e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4472  hypothetical protein  42.92 
 
 
251 aa  188  5e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.783879 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0709  hypothetical protein  39 
 
 
243 aa  188  5.999999999999999e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.162619  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2080  hypothetical protein  42.26 
 
 
268 aa  188  7e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.945675  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2585  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.93 
 
 
240 aa  187  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.749181  hitchhiker  0.00208948 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2660  hypothetical protein  44.35 
 
 
240 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1494  hypothetical protein  44.35 
 
 
240 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1713  hypothetical protein  44.35 
 
 
240 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.8421  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2738  Fe-S oxidoreductase  44.35 
 
 
240 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2222  hypothetical protein  44.35 
 
 
263 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1547  hypothetical protein  43.51 
 
 
240 aa  186  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198081  normal  0.0351499 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3098  hypothetical protein  44.35 
 
 
240 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00812964  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2604  hypothetical protein  44.35 
 
 
240 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.186656  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2282  hypothetical protein  47.48 
 
 
260 aa  186  3e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.293484  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43080  hypothetical protein  40.98 
 
 
274 aa  185  6e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1437  hypothetical protein  42.97 
 
 
247 aa  185  6e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2452  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  44.26 
 
 
247 aa  185  6e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.345477  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3243  hypothetical protein  44.81 
 
 
234 aa  184  8e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.496148  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0560  hypothetical protein  43.46 
 
 
265 aa  184  8e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.221453  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3730  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.49 
 
 
249 aa  184  9e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0542099  normal  0.363647 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2429  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.7 
 
 
248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267816 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1464  hypothetical protein  42.68 
 
 
240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.270606  normal  0.902058 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>