More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4458 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4458  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  501  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.169961 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0810  hypothetical protein  92.24 
 
 
249 aa  462  1e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0233285 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2718  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  73.33 
 
 
247 aa  357  9.999999999999999e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3038  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  49.39 
 
 
246 aa  224  7e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2593  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  48.1 
 
 
270 aa  218  6e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.128565  normal  0.0827191 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1216  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  45.15 
 
 
244 aa  216  4e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.770234  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0079  hypothetical protein  46.22 
 
 
260 aa  214  9.999999999999999e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.376514  unclonable  0.0000154463 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37080  Fe-S oxidoreductase  46.19 
 
 
243 aa  213  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.151092  normal  0.0205493 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0717  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  45.15 
 
 
248 aa  206  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3243  hypothetical protein  47.26 
 
 
234 aa  204  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.496148  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2926  hypothetical protein  44.49 
 
 
256 aa  202  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0345775  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0367  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  43.1 
 
 
259 aa  202  5e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2958  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  40.08 
 
 
242 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1769  hypothetical protein  46.19 
 
 
266 aa  199  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.329693  normal  0.0772008 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3263  hypothetical protein  39.66 
 
 
242 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1611  hypothetical protein  44.3 
 
 
241 aa  199  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0746419  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3164  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.39 
 
 
256 aa  199  5e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3037  hypothetical protein  39.24 
 
 
242 aa  199  5e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.291586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3270  hypothetical protein  39.24 
 
 
242 aa  199  5e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0392  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.76 
 
 
238 aa  198  5e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1274  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.02 
 
 
239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7370  cysteine-rich domain protein  41.15 
 
 
250 aa  194  8.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660622  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3259  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.97 
 
 
240 aa  194  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4385  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  42.8 
 
 
251 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1024  hypothetical protein  39.66 
 
 
239 aa  193  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4766  hypothetical protein  42.8 
 
 
251 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4472  hypothetical protein  42.8 
 
 
251 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.783879 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2452  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  43.64 
 
 
247 aa  192  3e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.345477  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1462  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.98 
 
 
227 aa  192  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0836578  normal  0.704766 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1755  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.35 
 
 
257 aa  192  4e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1935  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.19 
 
 
241 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.0152527 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04070  Fe-S oxidoreductase  45 
 
 
244 aa  188  5.999999999999999e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0880878 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0818  hypothetical protein  42.5 
 
 
241 aa  188  7e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.212327  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0967  hypothetical protein  39.41 
 
 
245 aa  188  7e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3563  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.4 
 
 
249 aa  188  8e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0102494  hitchhiker  0.00479184 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3990  hypothetical protein  38.4 
 
 
239 aa  187  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.441671  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1354  hypothetical protein  38.4 
 
 
239 aa  187  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1607  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.35 
 
 
241 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.096074  normal  0.366344 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3730  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.81 
 
 
249 aa  187  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0542099  normal  0.363647 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1218  hypothetical protein  38.4 
 
 
239 aa  186  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5226  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.98 
 
 
249 aa  187  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05130  Fe-S oxidoreductase  43.85 
 
 
267 aa  186  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1392  hypothetical protein  37.97 
 
 
239 aa  186  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1416  hypothetical protein  37.97 
 
 
239 aa  186  4e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1216  hypothetical protein  37.97 
 
 
239 aa  186  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0407054  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1194  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  37.97 
 
 
239 aa  186  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1196  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  37.97 
 
 
239 aa  186  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0498426  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1315  hypothetical protein  37.97 
 
 
239 aa  186  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4815  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.26 
 
 
247 aa  186  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1456  hypothetical protein  37.97 
 
 
239 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1034  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.15 
 
 
249 aa  185  5e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.92586  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3704  hypothetical protein  44.12 
 
 
246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.475833  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1096  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.95 
 
 
249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.757675 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1437  oxidoreductase  39.57 
 
 
246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.147364  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2709  hypothetical protein  41.84 
 
 
248 aa  182  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.270424  normal  0.129266 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2722  hypothetical protein  39.24 
 
 
242 aa  182  4.0000000000000006e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.451695  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3104  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.91 
 
 
267 aa  182  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1896  Fe-S oxidoreductase  35.15 
 
 
256 aa  182  5.0000000000000004e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.138109  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5452  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.07 
 
 
239 aa  182  6e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.625319 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3606  hypothetical protein  43.04 
 
 
270 aa  181  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0891  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.9 
 
 
264 aa  181  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.147863  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3622  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.49 
 
 
257 aa  179  2.9999999999999997e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0669  hypothetical protein  44.73 
 
 
243 aa  179  4e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0954341  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1905  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.59 
 
 
245 aa  178  7e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12950  Fe-S oxidoreductase  39.92 
 
 
261 aa  178  8e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0443672  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1375  hypothetical protein  39.33 
 
 
250 aa  177  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.267748  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1310  hypothetical protein  40.93 
 
 
241 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2995  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  40.83 
 
 
246 aa  177  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1413  hypothetical protein  40.24 
 
 
249 aa  176  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.170159  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1206  hypothetical protein  39.66 
 
 
241 aa  176  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.546437  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2001  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.1 
 
 
237 aa  176  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000985814  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2425  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.46 
 
 
244 aa  175  5e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00338747  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1713  hypothetical protein  42.08 
 
 
240 aa  175  7e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.8421  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2660  hypothetical protein  42.08 
 
 
240 aa  175  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3098  hypothetical protein  42.08 
 
 
240 aa  175  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00812964  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1494  hypothetical protein  42.08 
 
 
240 aa  175  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2604  hypothetical protein  42.08 
 
 
240 aa  175  7e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.186656  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2222  hypothetical protein  42.08 
 
 
263 aa  174  8e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2738  Fe-S oxidoreductase  42.08 
 
 
240 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1690  glycolate oxidase-like protein  40.59 
 
 
274 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0555  Fe-S oxidoreductase  41.18 
 
 
268 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05530  Fe-S oxidoreductase  38.27 
 
 
248 aa  174  1.9999999999999998e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0140  hypothetical protein  41.35 
 
 
263 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1870  hypothetical protein  42.08 
 
 
240 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214075  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1431  hypothetical protein  40.76 
 
 
268 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.667811  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2182  hypothetical protein  40.76 
 
 
268 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1873  hypothetical protein  40.76 
 
 
289 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0458  hypothetical protein  40.76 
 
 
268 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0867  hypothetical protein  40.76 
 
 
268 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.258503  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1766  hypothetical protein  39.73 
 
 
260 aa  172  5.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1437  hypothetical protein  38.62 
 
 
247 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3589  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.07 
 
 
265 aa  171  6.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1464  hypothetical protein  40.51 
 
 
240 aa  171  9e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.270606  normal  0.902058 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2080  hypothetical protein  40.51 
 
 
268 aa  170  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.945675  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1842  hypothetical protein  39.58 
 
 
265 aa  169  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00098228  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19840  Fe-S oxidoreductase  40.8 
 
 
284 aa  169  5e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0560  hypothetical protein  43.64 
 
 
265 aa  168  9e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.221453  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1139  hypothetical protein  40.93 
 
 
236 aa  167  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.79138  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2168  hypothetical protein  40.42 
 
 
240 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1547  hypothetical protein  39.58 
 
 
240 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198081  normal  0.0351499 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>