More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1421 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_1421  cysteine-rich domain-containing protein  100 
 
 
250 aa  527  1e-149  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4689  hypothetical protein  57.03 
 
 
261 aa  312  2.9999999999999996e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43080  hypothetical protein  57.6 
 
 
274 aa  308  4e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0752  hypothetical protein  57.6 
 
 
274 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.195276 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0364  hypothetical protein  55.6 
 
 
275 aa  300  1e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.228325  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1715  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  54.66 
 
 
277 aa  294  1e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1766  hypothetical protein  51.98 
 
 
260 aa  271  6e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0201  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich protein  51.97 
 
 
267 aa  266  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5899  hypothetical protein  50.78 
 
 
261 aa  263  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5448  hypothetical protein  50.79 
 
 
259 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.950541  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6081  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  51.97 
 
 
266 aa  263  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2803  hypothetical protein  51.57 
 
 
266 aa  262  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.632072  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2670  hypothetical protein  51.18 
 
 
266 aa  261  6e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5378  hypothetical protein  51 
 
 
264 aa  260  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441128  normal  0.860708 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0397  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  47.18 
 
 
253 aa  257  1e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110974 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1413  hypothetical protein  50.61 
 
 
249 aa  256  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.170159  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1375  hypothetical protein  46.8 
 
 
250 aa  251  1e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.267748  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1842  hypothetical protein  46.4 
 
 
265 aa  236  4e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00098228  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0086  hypothetical protein  44.4 
 
 
245 aa  225  4e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0071  hypothetical protein  43.98 
 
 
246 aa  221  8e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0112  hypothetical protein  43.98 
 
 
246 aa  221  9.999999999999999e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1454  cysteine-rich domain protein  41.67 
 
 
245 aa  211  7.999999999999999e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00283589  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0884  hypothetical protein  43.75 
 
 
244 aa  208  6e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2958  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  39.41 
 
 
242 aa  190  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3263  hypothetical protein  38.98 
 
 
242 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3037  hypothetical protein  38.56 
 
 
242 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.291586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3270  hypothetical protein  38.56 
 
 
242 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0140  hypothetical protein  40.57 
 
 
263 aa  186  4e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2222  hypothetical protein  40.98 
 
 
263 aa  185  5e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0367  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  40.76 
 
 
259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1310  hypothetical protein  41.35 
 
 
241 aa  182  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3164  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.4 
 
 
256 aa  182  6e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1870  hypothetical protein  41.77 
 
 
240 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214075  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1713  hypothetical protein  41.35 
 
 
240 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.8421  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1494  hypothetical protein  41.35 
 
 
240 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2738  Fe-S oxidoreductase  41.35 
 
 
240 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2660  hypothetical protein  41.35 
 
 
240 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1769  hypothetical protein  37.82 
 
 
266 aa  181  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.329693  normal  0.0772008 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3098  hypothetical protein  41.35 
 
 
240 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00812964  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1607  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.66 
 
 
241 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.096074  normal  0.366344 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2604  hypothetical protein  41.35 
 
 
240 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.186656  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1611  hypothetical protein  39.66 
 
 
241 aa  180  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0746419  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1547  hypothetical protein  40.93 
 
 
240 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198081  normal  0.0351499 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1206  hypothetical protein  41.35 
 
 
241 aa  180  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.546437  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1935  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.24 
 
 
241 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.0152527 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0392  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39 
 
 
238 aa  176  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2585  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.51 
 
 
240 aa  176  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.749181  hitchhiker  0.00208948 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2148  hypothetical protein  40.08 
 
 
240 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11459  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2041  hypothetical protein  39.66 
 
 
240 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.914482  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5437  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  39.24 
 
 
240 aa  171  9e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135566  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1274  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.02 
 
 
239 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2168  hypothetical protein  39.66 
 
 
240 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1024  hypothetical protein  36.67 
 
 
239 aa  171  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1464  hypothetical protein  40.08 
 
 
240 aa  170  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.270606  normal  0.902058 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1139  hypothetical protein  39.91 
 
 
236 aa  169  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.79138  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0717  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.04 
 
 
248 aa  169  4e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5946  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  39.24 
 
 
240 aa  168  9e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0860628  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2131  hypothetical protein  39.24 
 
 
240 aa  168  9e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198327  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0967  hypothetical protein  36.44 
 
 
245 aa  168  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3990  hypothetical protein  36.78 
 
 
239 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.441671  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1416  hypothetical protein  36.78 
 
 
239 aa  165  8e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1216  hypothetical protein  36.78 
 
 
239 aa  165  8e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0407054  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1194  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  36.78 
 
 
239 aa  165  8e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1196  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  36.78 
 
 
239 aa  165  8e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0498426  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1456  hypothetical protein  36.78 
 
 
239 aa  165  8e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1315  hypothetical protein  36.78 
 
 
239 aa  165  8e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1218  hypothetical protein  36.78 
 
 
239 aa  165  8e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1354  hypothetical protein  36.36 
 
 
239 aa  164  9e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1392  hypothetical protein  36.36 
 
 
239 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0079  hypothetical protein  34.91 
 
 
260 aa  160  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.376514  unclonable  0.0000154463 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2722  hypothetical protein  33.47 
 
 
242 aa  158  7e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.451695  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1216  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.45 
 
 
244 aa  157  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.770234  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0810  hypothetical protein  32.26 
 
 
249 aa  157  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0233285 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2593  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.82 
 
 
270 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.128565  normal  0.0827191 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2080  hypothetical protein  34.6 
 
 
268 aa  155  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.945675  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0560  hypothetical protein  39.57 
 
 
265 aa  155  5.0000000000000005e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.221453  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3606  hypothetical protein  35.83 
 
 
270 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4815  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.08 
 
 
247 aa  154  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2995  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  34.69 
 
 
246 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1690  glycolate oxidase-like protein  37.13 
 
 
274 aa  153  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1896  Fe-S oxidoreductase  34.03 
 
 
256 aa  152  5e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.138109  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2926  hypothetical protein  34.68 
 
 
256 aa  152  7e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0345775  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2677  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.02 
 
 
239 aa  151  8.999999999999999e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3259  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.03 
 
 
240 aa  151  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1431  hypothetical protein  34.18 
 
 
268 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.667811  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1873  hypothetical protein  34.18 
 
 
289 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0555  Fe-S oxidoreductase  34.18 
 
 
268 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0867  hypothetical protein  34.18 
 
 
268 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.258503  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3589  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.99 
 
 
265 aa  151  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2182  hypothetical protein  34.18 
 
 
268 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0458  hypothetical protein  34.18 
 
 
268 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2718  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.48 
 
 
247 aa  150  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1749  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.42 
 
 
239 aa  149  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0856492  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2429  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.44 
 
 
248 aa  149  5e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267816 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1905  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.77 
 
 
245 aa  148  8e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4458  hypothetical protein  31.93 
 
 
247 aa  147  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.169961 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1397  hypothetical protein  33.88 
 
 
262 aa  146  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0709  hypothetical protein  31.25 
 
 
243 aa  145  7.0000000000000006e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.162619  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12950  Fe-S oxidoreductase  35.66 
 
 
261 aa  144  9e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0443672  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2768  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.61 
 
 
239 aa  144  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>