100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0631 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0631  hypothetical protein  100 
 
 
83 aa  169  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0556  hypothetical protein  60.24 
 
 
83 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1650  hypothetical protein  57.32 
 
 
85 aa  96.3  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00520982  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2480  putative solute symporter protein  64.47 
 
 
82 aa  96.7  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.029038 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3156  Maf-like protein  58.44 
 
 
87 aa  96.7  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3833  membrane protein  58.54 
 
 
86 aa  96.3  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.536523 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00159  hypothetical protein  55.13 
 
 
105 aa  95.1  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0487  hypothetical protein  53.66 
 
 
85 aa  94  6e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0195334  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2827  hypothetical protein  50 
 
 
113 aa  89.7  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002208  hypothetical protein  51.22 
 
 
87 aa  89  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00720  hypothetical protein  48.78 
 
 
88 aa  87.4  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1770  hypothetical protein  52.27 
 
 
91 aa  85.5  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0986234  normal  0.427935 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3405  hypothetical protein  50 
 
 
95 aa  85.9  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.760954  normal  0.315364 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2277  hypothetical protein  51.28 
 
 
88 aa  85.9  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0524  hypothetical protein  47.56 
 
 
92 aa  85.5  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0508  membrane protein-like protein  50 
 
 
93 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.120119 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1864  putative solute symporter protein  47.62 
 
 
87 aa  83.6  8e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0698534  normal  0.307528 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2753  hypothetical protein  51.28 
 
 
88 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070316 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1710  hypothetical protein  51.28 
 
 
88 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000109022 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1793  hypothetical protein  51.22 
 
 
85 aa  82.8  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000127525  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2674  hypothetical protein  51.28 
 
 
88 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.476538  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2639  hypothetical protein  51.28 
 
 
88 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2230  hypothetical protein  47.56 
 
 
93 aa  82  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.273164  normal  0.935869 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0577  hypothetical protein  47.56 
 
 
86 aa  82  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2359  hypothetical protein  46.34 
 
 
88 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1546  hypothetical protein  48.68 
 
 
88 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.704875  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3755  hypothetical protein  46.43 
 
 
85 aa  80.1  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.55636  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3697  hypothetical protein  46.43 
 
 
85 aa  80.1  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0280  membrane protein-like protein  45.12 
 
 
86 aa  79.7  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00038588  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5742  putative solute symporter protein  53.66 
 
 
115 aa  80.1  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2858  hypothetical protein  47.44 
 
 
88 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1745  hypothetical protein  48.72 
 
 
88 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.588903  hitchhiker  0.0000483214 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1695  hypothetical protein  47.44 
 
 
88 aa  79  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.745801  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4789  hypothetical protein  51.35 
 
 
84 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2372  hypothetical protein  47.44 
 
 
88 aa  79  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.810646  hitchhiker  0.000114993 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2051  Maf-like protein  48.19 
 
 
91 aa  79  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.342839 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1580  hypothetical protein  47.44 
 
 
88 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188511  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1513  hypothetical protein  47.44 
 
 
88 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712385 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1574  hypothetical protein  47.44 
 
 
88 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000101201 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1041  membrane protein  50 
 
 
86 aa  78.2  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.464753 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3838  hypothetical protein  45.24 
 
 
85 aa  77.8  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.313287  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0087  hypothetical protein  45 
 
 
88 aa  77.4  0.00000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.161414 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0872  hypothetical protein  45.12 
 
 
86 aa  77.4  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.38299  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2839  hypothetical protein  47.44 
 
 
88 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.82179  hitchhiker  0.0000856342 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0318  hypothetical protein  50.67 
 
 
99 aa  76.6  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00269731  hitchhiker  0.00788498 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0262  hypothetical protein  47.56 
 
 
90 aa  75.9  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3665  hypothetical protein  43.9 
 
 
86 aa  75.9  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1176  hypothetical protein  43.9 
 
 
84 aa  75.9  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1497  hypothetical protein  42.68 
 
 
96 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.021579  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1522  hypothetical protein  46.15 
 
 
88 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.21911  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2253  hypothetical protein  41.98 
 
 
86 aa  73.6  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.935196  normal  0.0501175 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4551  hypothetical protein  42.68 
 
 
85 aa  71.6  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4953  hypothetical protein  44.16 
 
 
83 aa  71.2  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1959  hypothetical protein  40.74 
 
 
94 aa  71.2  0.000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.859068 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1299  membrane protein  46.34 
 
 
84 aa  71.2  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.863066 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1262  hypothetical protein  36.59 
 
 
85 aa  70.5  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0702268  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1440  hypothetical protein  41.67 
 
 
86 aa  70.5  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3555  hypothetical protein  41.46 
 
 
85 aa  69.3  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.788833  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4039  putative solute symporter protein  43.04 
 
 
83 aa  69.3  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0901  hypothetical protein  41.46 
 
 
87 aa  68.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.703868  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3461  membrane protein-like protein  41.03 
 
 
93 aa  68.2  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000680591  normal  0.123205 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1265  hypothetical protein  44.87 
 
 
86 aa  67  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1629  membrane protein-like protein  36.59 
 
 
93 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.604047  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2263  membrane protein-like protein  36.59 
 
 
93 aa  66.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000225575 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4102  membrane protein-like protein  37.8 
 
 
86 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3138  membrane protein-like protein  37.35 
 
 
151 aa  63.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0245  SSS sodium solute transporter superfamily  41.25 
 
 
729 aa  63.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1638  membrane protein  42.31 
 
 
83 aa  60.1  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.317317  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1524  membrane protein  36.14 
 
 
85 aa  55.1  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.261907  normal  0.0715652 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3112  hypothetical protein  39.74 
 
 
131 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985689  decreased coverage  0.0000131927 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5063  hypothetical protein  40.79 
 
 
126 aa  53.5  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.243596 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0351  Na+/solute symporter  33.75 
 
 
759 aa  53.5  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.572111  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0112  Na+/solute symporter  40 
 
 
760 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0865  hypothetical protein  36.36 
 
 
98 aa  52.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0675484  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1417  membrane protein  38.36 
 
 
126 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.1208 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3040  hypothetical protein  34.62 
 
 
90 aa  51.6  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1080  hypothetical protein  41.43 
 
 
137 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.395467  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2215  membrane protein-like protein  42.25 
 
 
114 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107941  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5519  membrane protein-like  39.44 
 
 
114 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.511237  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2832  hypothetical protein  37.5 
 
 
90 aa  50.8  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2190  membrane protein-like protein  42.25 
 
 
114 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5887  membrane protein-like  42.25 
 
 
114 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4145  membrane protein-like  35.9 
 
 
86 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257002  normal  0.0353718 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1793  hypothetical protein  41.43 
 
 
106 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.28026  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0787  hypothetical protein  41.43 
 
 
106 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0531  hypothetical protein  41.43 
 
 
106 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0629  hypothetical protein  41.43 
 
 
106 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.218405  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2016  hypothetical protein  38.03 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.220495  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2108  membrane protein-like protein  38.03 
 
 
114 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2229  membrane protein-like protein  38.03 
 
 
114 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1086  membrane protein-like protein  38.03 
 
 
114 aa  47  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.541558  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0463  hypothetical protein  34.62 
 
 
106 aa  47  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2192  Na+/solute symporter  40 
 
 
769 aa  44.7  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.560167  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2397  hypothetical protein  29.49 
 
 
86 aa  44.3  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.928873 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2051  membrane protein-like protein  40 
 
 
117 aa  43.9  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.708436  normal  0.400177 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2365  hypothetical protein  36.84 
 
 
105 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396168  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1023  membrane protein  29.49 
 
 
87 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.451151  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2878  hypothetical protein  36.84 
 
 
105 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.127275  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1383  hypothetical protein  40.91 
 
 
130 aa  41.6  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.270467  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0975  putative solute symporter protein  34.52 
 
 
156 aa  40.8  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>