26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2832 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2832  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  179  8.000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1864  putative solute symporter protein  33.77 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0698534  normal  0.307528 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1023  membrane protein  34.21 
 
 		 87 aa  51.6  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.451151  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0631  hypothetical protein  37.5 
 
 		 83 aa  50.8  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0556  hypothetical protein  29.58 
 
 		 83 aa  50.8  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1497  hypothetical protein  31.18 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.021579  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1638  membrane protein  33.82 
 
 		 83 aa  47.4  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.317317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1265  hypothetical protein  37.5 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1524  membrane protein  29.87 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.261907  normal  0.0715652 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0865  hypothetical protein  37.35 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0675484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5063  hypothetical protein  41.07 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243596 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2397  hypothetical protein  34.21 
 
 		 86 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.928873 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0487  hypothetical protein  30.65 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0195334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2480  putative solute symporter protein  33.33 
 
 		 82 aa  45.1  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.029038 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2051  membrane protein-like protein  33.33 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.708436  normal  0.400177 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4145  membrane protein-like  32.86 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257002  normal  0.0353718 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2365  hypothetical protein  37.68 
 
 		 105 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396168  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1650  hypothetical protein  28.57 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00520982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3040  hypothetical protein  36.71 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2051  Maf-like protein  31.71 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.342839 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2277  hypothetical protein  32.31 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2878  hypothetical protein  37.68 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.127275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4789  hypothetical protein  34.48 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1383  hypothetical protein  36.84 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.270467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3156  Maf-like protein  28.17 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0463  hypothetical protein  27.91 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>