95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0508 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0508  membrane protein-like protein  100 
 
 		 93 aa  188  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.120119 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2230  hypothetical protein  95.7 
 
 		 93 aa  183  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.273164  normal  0.935869 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0577  hypothetical protein  94.19 
 
 		 86 aa  166  7e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3665  hypothetical protein  71.43 
 
 		 86 aa  123  8.000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0280  membrane protein-like protein  66.67 
 
 		 86 aa  118  3e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00038588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4551  hypothetical protein  66.67 
 
 		 85 aa  118  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3555  hypothetical protein  64.29 
 
 		 85 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.788833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1959  hypothetical protein  54.84 
 
 		 94 aa  116  9.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.859068 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2253  hypothetical protein  59.52 
 
 		 86 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.935196  normal  0.0501175 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4102  membrane protein-like protein  58.14 
 
 		 86 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1440  hypothetical protein  56.98 
 
 		 86 aa  108  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0872  hypothetical protein  56.98 
 
 		 86 aa  107  5e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.38299  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1864  putative solute symporter protein  56.98 
 
 		 87 aa  104  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0698534  normal  0.307528 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0901  hypothetical protein  56.98 
 
 		 87 aa  103  9e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.703868  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0318  hypothetical protein  57.14 
 
 		 99 aa  97.8  5e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00269731  hitchhiker  0.00788498 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00159  hypothetical protein  48.35 
 
 		 105 aa  97.1  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0524  hypothetical protein  48.89 
 
 		 92 aa  96.3  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002208  hypothetical protein  51.19 
 
 		 87 aa  94  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1650  hypothetical protein  54.22 
 
 		 85 aa  93.6  7e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00520982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2827  hypothetical protein  53.57 
 
 		 113 aa  94  7e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4953  hypothetical protein  59.74 
 
 		 83 aa  93.6  9e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2051  Maf-like protein  53.76 
 
 		 91 aa  93.2  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.342839 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3156  Maf-like protein  48.81 
 
 		 87 aa  92  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0087  hypothetical protein  52.5 
 
 		 88 aa  91.7  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.161414 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2858  hypothetical protein  53.57 
 
 		 88 aa  89.7  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1513  hypothetical protein  53.57 
 
 		 88 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00712385 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1580  hypothetical protein  53.57 
 
 		 88 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188511  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2639  hypothetical protein  52.38 
 
 		 88 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2753  hypothetical protein  52.38 
 
 		 88 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070316 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1710  hypothetical protein  52.38 
 
 		 88 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000109022 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2674  hypothetical protein  52.38 
 
 		 88 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.476538  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2359  hypothetical protein  53.57 
 
 		 88 aa  88.6  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1574  hypothetical protein  53.57 
 
 		 88 aa  89  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000101201 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0487  hypothetical protein  49.4 
 
 		 85 aa  89  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0195334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1522  hypothetical protein  48.81 
 
 		 88 aa  87.4  7e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.21911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0262  hypothetical protein  48.81 
 
 		 90 aa  87  7e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00720  hypothetical protein  50.6 
 
 		 88 aa  87  8e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2480  putative solute symporter protein  53.09 
 
 		 82 aa  87  8e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.029038 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2277  hypothetical protein  52.38 
 
 		 88 aa  86.3  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1770  hypothetical protein  48.31 
 
 		 91 aa  85.5  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0986234  normal  0.427935 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2372  hypothetical protein  51.19 
 
 		 88 aa  85.5  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.810646  hitchhiker  0.000114993 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1546  hypothetical protein  51.19 
 
 		 88 aa  85.5  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.704875  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1695  hypothetical protein  51.19 
 
 		 88 aa  85.5  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.745801  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1262  hypothetical protein  49.4 
 
 		 85 aa  85.9  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0702268  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0631  hypothetical protein  50 
 
 		 83 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0556  hypothetical protein  50 
 
 		 83 aa  84  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1745  hypothetical protein  50 
 
 		 88 aa  83.6  8e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.588903  hitchhiker  0.0000483214 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3833  membrane protein  53.85 
 
 		 86 aa  83.6  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.536523 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2839  hypothetical protein  50 
 
 		 88 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.82179  hitchhiker  0.0000856342 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1793  hypothetical protein  49.4 
 
 		 85 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000127525  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4789  hypothetical protein  53.16 
 
 		 84 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1041  membrane protein  55.95 
 
 		 86 aa  81.6  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464753 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3697  hypothetical protein  48.19 
 
 		 85 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3755  hypothetical protein  48.19 
 
 		 85 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.55636  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3405  hypothetical protein  48.19 
 
 		 95 aa  79.3  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.760954  normal  0.315364 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3838  hypothetical protein  46.99 
 
 		 85 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.313287  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1176  hypothetical protein  43.37 
 
 		 84 aa  73.2  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1299  membrane protein  45.78 
 
 		 84 aa  70.9  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.863066 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3461  membrane protein-like protein  39.78 
 
 		 93 aa  70.5  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000680591  normal  0.123205 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3138  membrane protein-like protein  43.42 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4039  putative solute symporter protein  46.25 
 
 		 83 aa  66.6  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1629  membrane protein-like protein  40.48 
 
 		 93 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.604047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2263  membrane protein-like protein  39.08 
 
 		 93 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225575 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1497  hypothetical protein  39.02 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.021579  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5742  putative solute symporter protein  44.32 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2229  membrane protein-like protein  48.57 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0351  Na+/solute symporter  41.98 
 
 		 759 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.572111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2108  membrane protein-like protein  48.57 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1417  membrane protein  41.33 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.1208 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1265  hypothetical protein  36.71 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1524  membrane protein  38.16 
 
 		 85 aa  55.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.261907  normal  0.0715652 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4145  membrane protein-like  39.74 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257002  normal  0.0353718 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3112  hypothetical protein  40 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985689  decreased coverage  0.0000131927 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0245  SSS sodium solute transporter superfamily  42.11 
 
 		 729 aa  55.1  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5519  membrane protein-like  45.71 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.511237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2215  membrane protein-like protein  44.29 
 
 		 114 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1638  membrane protein  35 
 
 		 83 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.317317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2190  membrane protein-like protein  44.29 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5887  membrane protein-like  44.29 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0112  Na+/solute symporter  37.36 
 
 		 760 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1086  membrane protein-like protein  44.29 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.541558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1023  membrane protein  30.23 
 
 		 87 aa  50.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.451151  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2016  hypothetical protein  41.33 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.220495  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1793  hypothetical protein  44.29 
 
 		 106 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.28026  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2192  Na+/solute symporter  49.15 
 
 		 769 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.560167  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0531  hypothetical protein  44.29 
 
 		 106 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0629  hypothetical protein  44.29 
 
 		 106 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.218405  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0787  hypothetical protein  44.29 
 
 		 106 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3040  hypothetical protein  33.75 
 
 		 90 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2397  hypothetical protein  30.26 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.928873 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1080  hypothetical protein  38.82 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.395467  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0463  hypothetical protein  35.71 
 
 		 106 aa  47.4  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2051  membrane protein-like protein  41.51 
 
 		 117 aa  47.4  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.708436  normal  0.400177 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0865  hypothetical protein  28.57 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0675484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0524  hypothetical protein  29.76 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>