98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0318 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0318  hypothetical protein  100 
 
 
99 aa  198  1.9999999999999998e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00269731  hitchhiker  0.00788498 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0524  hypothetical protein  57.14 
 
 
92 aa  102  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0872  hypothetical protein  57.14 
 
 
86 aa  99.8  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.38299  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4551  hypothetical protein  62.03 
 
 
85 aa  98.6  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1864  putative solute symporter protein  59.04 
 
 
87 aa  97.8  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0698534  normal  0.307528 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0508  membrane protein-like protein  57.14 
 
 
93 aa  97.8  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.120119 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0901  hypothetical protein  58.75 
 
 
87 aa  97.1  8e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.703868  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0577  hypothetical protein  55.95 
 
 
86 aa  96.7  8e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2230  hypothetical protein  54.76 
 
 
93 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.273164  normal  0.935869 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3156  Maf-like protein  50 
 
 
87 aa  95.5  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00159  hypothetical protein  54.76 
 
 
105 aa  94.4  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3665  hypothetical protein  57.32 
 
 
86 aa  93.6  8e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002208  hypothetical protein  54.76 
 
 
87 aa  92.8  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2051  Maf-like protein  52.56 
 
 
91 aa  93.2  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.342839 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2827  hypothetical protein  54.22 
 
 
113 aa  92.8  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2253  hypothetical protein  50.62 
 
 
86 aa  92.8  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.935196  normal  0.0501175 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3555  hypothetical protein  55.13 
 
 
85 aa  92.8  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.788833  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1959  hypothetical protein  48.19 
 
 
94 aa  91.7  3e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.859068 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0087  hypothetical protein  56.25 
 
 
88 aa  90.9  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.161414 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0280  membrane protein-like protein  51.85 
 
 
86 aa  90.5  6e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00038588  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4789  hypothetical protein  51.22 
 
 
84 aa  90.5  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4102  membrane protein-like protein  53.57 
 
 
86 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1440  hypothetical protein  53.09 
 
 
86 aa  89  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1650  hypothetical protein  54.55 
 
 
85 aa  88.2  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00520982  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2277  hypothetical protein  51.81 
 
 
88 aa  88.6  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2480  putative solute symporter protein  59.72 
 
 
82 aa  88.6  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.029038 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1262  hypothetical protein  50.63 
 
 
85 aa  87  7e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0702268  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0487  hypothetical protein  47.56 
 
 
85 aa  86.3  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0195334  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3833  membrane protein  53.09 
 
 
86 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.536523 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1522  hypothetical protein  49.4 
 
 
88 aa  85.5  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.21911  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00720  hypothetical protein  48.19 
 
 
88 aa  84.7  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4953  hypothetical protein  50.65 
 
 
83 aa  84.7  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3405  hypothetical protein  49.37 
 
 
95 aa  84  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.760954  normal  0.315364 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0262  hypothetical protein  51.22 
 
 
90 aa  83.6  8e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1176  hypothetical protein  52.56 
 
 
84 aa  83.6  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2359  hypothetical protein  49.4 
 
 
88 aa  80.5  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2674  hypothetical protein  49.4 
 
 
88 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.476538  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2639  hypothetical protein  49.4 
 
 
88 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1710  hypothetical protein  49.4 
 
 
88 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000109022 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2753  hypothetical protein  49.4 
 
 
88 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070316 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2858  hypothetical protein  49.4 
 
 
88 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1770  hypothetical protein  51.81 
 
 
91 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0986234  normal  0.427935 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0556  hypothetical protein  48.72 
 
 
83 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1513  hypothetical protein  49.4 
 
 
88 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712385 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1580  hypothetical protein  49.4 
 
 
88 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188511  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1574  hypothetical protein  49.4 
 
 
88 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000101201 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1793  hypothetical protein  47.56 
 
 
85 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000127525  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1546  hypothetical protein  45.78 
 
 
88 aa  77  0.00000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.704875  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2372  hypothetical protein  46.99 
 
 
88 aa  77  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.810646  hitchhiker  0.000114993 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1695  hypothetical protein  45.78 
 
 
88 aa  77  0.00000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.745801  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2263  membrane protein-like protein  45.95 
 
 
93 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000225575 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1745  hypothetical protein  46.99 
 
 
88 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.588903  hitchhiker  0.0000483214 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0631  hypothetical protein  50.67 
 
 
83 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1299  membrane protein  51.25 
 
 
84 aa  76.6  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.863066 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3755  hypothetical protein  50 
 
 
85 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.55636  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3838  hypothetical protein  50 
 
 
85 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.313287  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3697  hypothetical protein  50 
 
 
85 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4039  putative solute symporter protein  48.72 
 
 
83 aa  75.1  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3461  membrane protein-like protein  44.59 
 
 
93 aa  74.3  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000680591  normal  0.123205 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1629  membrane protein-like protein  44.59 
 
 
93 aa  74.3  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.604047  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5742  putative solute symporter protein  53.33 
 
 
115 aa  73.9  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1041  membrane protein  54.55 
 
 
86 aa  74.3  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.464753 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2839  hypothetical protein  45.78 
 
 
88 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.82179  hitchhiker  0.0000856342 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1497  hypothetical protein  45.83 
 
 
96 aa  66.2  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.021579  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1265  hypothetical protein  45.33 
 
 
86 aa  63.9  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3138  membrane protein-like protein  37.21 
 
 
151 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0245  SSS sodium solute transporter superfamily  41.57 
 
 
729 aa  62  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2397  hypothetical protein  32.26 
 
 
86 aa  61.6  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.928873 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3112  hypothetical protein  40 
 
 
131 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985689  decreased coverage  0.0000131927 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3040  hypothetical protein  34.78 
 
 
90 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1417  membrane protein  38.37 
 
 
126 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.1208 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1524  membrane protein  37.33 
 
 
85 aa  56.6  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.261907  normal  0.0715652 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0865  hypothetical protein  38.1 
 
 
98 aa  54.7  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0675484  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1638  membrane protein  36.49 
 
 
83 aa  52.4  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.317317  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4145  membrane protein-like  32.18 
 
 
86 aa  51.2  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257002  normal  0.0353718 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0463  hypothetical protein  33.75 
 
 
106 aa  50.4  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2051  membrane protein-like protein  45.61 
 
 
117 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.708436  normal  0.400177 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0351  Na+/solute symporter  35.63 
 
 
759 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.572111  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2016  hypothetical protein  38.67 
 
 
126 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.220495  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1793  hypothetical protein  38.75 
 
 
106 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.28026  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0531  hypothetical protein  38.75 
 
 
106 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0629  hypothetical protein  38.75 
 
 
106 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.218405  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0787  hypothetical protein  38.75 
 
 
106 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2215  membrane protein-like protein  36.25 
 
 
114 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107941  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5519  membrane protein-like  38.36 
 
 
114 aa  47.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.511237  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2190  membrane protein-like protein  39.73 
 
 
114 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1080  hypothetical protein  40 
 
 
137 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.395467  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5887  membrane protein-like  39.73 
 
 
114 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1023  membrane protein  34.15 
 
 
87 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.451151  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2365  hypothetical protein  36.71 
 
 
105 aa  44.7  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396168  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2878  hypothetical protein  35.71 
 
 
105 aa  44.7  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.127275  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5063  hypothetical protein  35.82 
 
 
126 aa  44.7  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.243596 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2192  Na+/solute symporter  48.33 
 
 
769 aa  44.7  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.560167  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2108  membrane protein-like protein  39.44 
 
 
114 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2229  membrane protein-like protein  39.44 
 
 
114 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1086  membrane protein-like protein  36 
 
 
114 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.541558  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0524  hypothetical protein  30.67 
 
 
106 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270703  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1383  hypothetical protein  43.18 
 
 
130 aa  41.6  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.270467  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>