82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A0629 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1793  hypothetical protein  100 
 
 
106 aa  207  3e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.28026  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0787  hypothetical protein  100 
 
 
106 aa  207  3e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0629  hypothetical protein  100 
 
 
106 aa  207  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.218405  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0531  hypothetical protein  100 
 
 
106 aa  207  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1080  hypothetical protein  98.11 
 
 
137 aa  202  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.395467  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2016  hypothetical protein  89.62 
 
 
126 aa  191  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.220495  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2215  membrane protein-like protein  81.72 
 
 
114 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107941  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1086  membrane protein-like protein  81.11 
 
 
114 aa  144  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.541558  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2190  membrane protein-like protein  82.76 
 
 
114 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5887  membrane protein-like  82.76 
 
 
114 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5519  membrane protein-like  82.76 
 
 
114 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.511237  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2108  membrane protein-like protein  81.61 
 
 
114 aa  137  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2229  membrane protein-like protein  81.61 
 
 
114 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1417  membrane protein  73.81 
 
 
126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.1208 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3112  hypothetical protein  64.36 
 
 
131 aa  121  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985689  decreased coverage  0.0000131927 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1937  membrane protein  67.35 
 
 
121 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1265  hypothetical protein  48.61 
 
 
86 aa  63.9  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3461  membrane protein-like protein  39.47 
 
 
93 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000680591  normal  0.123205 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3040  hypothetical protein  44.74 
 
 
90 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0463  hypothetical protein  36.67 
 
 
106 aa  57  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2397  hypothetical protein  40.51 
 
 
86 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.928873 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2263  membrane protein-like protein  39.71 
 
 
93 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000225575 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1650  hypothetical protein  42.25 
 
 
85 aa  55.5  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00520982  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1629  membrane protein-like protein  39.71 
 
 
93 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.604047  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00720  hypothetical protein  40 
 
 
88 aa  53.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4145  membrane protein-like  37.66 
 
 
86 aa  51.6  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257002  normal  0.0353718 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00159  hypothetical protein  40.79 
 
 
105 aa  51.6  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2277  hypothetical protein  36.36 
 
 
88 aa  52  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3838  hypothetical protein  42.86 
 
 
85 aa  51.2  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.313287  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3833  membrane protein  40.26 
 
 
86 aa  51.2  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.536523 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0524  hypothetical protein  39.47 
 
 
106 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270703  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3755  hypothetical protein  42.86 
 
 
85 aa  50.8  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.55636  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3697  hypothetical protein  42.86 
 
 
85 aa  50.8  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3138  membrane protein-like protein  34.29 
 
 
151 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0524  hypothetical protein  38.57 
 
 
92 aa  50.1  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002208  hypothetical protein  39.51 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0631  hypothetical protein  41.43 
 
 
83 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0508  membrane protein-like protein  44.29 
 
 
93 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.120119 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4789  hypothetical protein  42.11 
 
 
84 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0087  hypothetical protein  37.04 
 
 
88 aa  48.9  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.161414 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1524  membrane protein  34.78 
 
 
85 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.261907  normal  0.0715652 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0865  hypothetical protein  36.9 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0675484  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0318  hypothetical protein  38.75 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00269731  hitchhiker  0.00788498 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2827  hypothetical protein  37.14 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1262  hypothetical protein  38.89 
 
 
85 aa  48.1  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0702268  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0487  hypothetical protein  33.8 
 
 
85 aa  48.1  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0195334  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1770  hypothetical protein  38.96 
 
 
91 aa  47  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0986234  normal  0.427935 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0556  hypothetical protein  33.77 
 
 
83 aa  47  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0351  Na+/solute symporter  36.99 
 
 
759 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.572111  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4039  putative solute symporter protein  38.57 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0112  Na+/solute symporter  36.59 
 
 
760 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1546  hypothetical protein  37.5 
 
 
88 aa  45.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.704875  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0577  hypothetical protein  40 
 
 
86 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2230  hypothetical protein  40 
 
 
93 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.273164  normal  0.935869 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1497  hypothetical protein  32.05 
 
 
96 aa  44.3  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.021579  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1695  hypothetical protein  37.14 
 
 
88 aa  44.3  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.745801  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3405  hypothetical protein  35.71 
 
 
95 aa  44.3  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.760954  normal  0.315364 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1745  hypothetical protein  38.57 
 
 
88 aa  43.9  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.588903  hitchhiker  0.0000483214 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3156  Maf-like protein  32.88 
 
 
87 aa  43.9  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1638  membrane protein  32.53 
 
 
83 aa  43.9  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.317317  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0280  membrane protein-like protein  32.89 
 
 
86 aa  43.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00038588  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2480  putative solute symporter protein  35.71 
 
 
82 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.029038 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1176  hypothetical protein  37.66 
 
 
84 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1710  hypothetical protein  40.98 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000109022 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2253  hypothetical protein  35.71 
 
 
86 aa  42.7  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.935196  normal  0.0501175 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2674  hypothetical protein  40.98 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.476538  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2753  hypothetical protein  40.98 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070316 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0262  hypothetical protein  41.94 
 
 
90 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2639  hypothetical protein  40.98 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2372  hypothetical protein  37.14 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.810646  hitchhiker  0.000114993 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2051  Maf-like protein  28.89 
 
 
91 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.342839 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1522  hypothetical protein  36.07 
 
 
88 aa  41.6  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.21911  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1023  membrane protein  32.56 
 
 
87 aa  41.6  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.451151  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2839  hypothetical protein  37.14 
 
 
88 aa  41.6  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.82179  hitchhiker  0.0000856342 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0245  SSS sodium solute transporter superfamily  36.99 
 
 
729 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4953  hypothetical protein  33.78 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2359  hypothetical protein  40.98 
 
 
88 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4102  membrane protein-like protein  34.57 
 
 
86 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1793  hypothetical protein  34.72 
 
 
85 aa  40.8  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000127525  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4551  hypothetical protein  37.68 
 
 
85 aa  40.8  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2858  hypothetical protein  37.7 
 
 
88 aa  40  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0872  hypothetical protein  34.29 
 
 
86 aa  40  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.38299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>