91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4551 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4551  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  172  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3665  hypothetical protein  78.82 
 
 		 86 aa  143  7.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3555  hypothetical protein  70.59 
 
 		 85 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.788833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2253  hypothetical protein  67.06 
 
 		 86 aa  130  7.999999999999999e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.935196  normal  0.0501175 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1959  hypothetical protein  64.71 
 
 		 94 aa  127  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.859068 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0280  membrane protein-like protein  65.88 
 
 		 86 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00038588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4102  membrane protein-like protein  69.05 
 
 		 86 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0872  hypothetical protein  65.48 
 
 		 86 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.38299  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0577  hypothetical protein  69.05 
 
 		 86 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2230  hypothetical protein  69.05 
 
 		 93 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.273164  normal  0.935869 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0901  hypothetical protein  71.25 
 
 		 87 aa  120  6e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.703868  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1440  hypothetical protein  66.28 
 
 		 86 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0508  membrane protein-like protein  66.67 
 
 		 93 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.120119 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0318  hypothetical protein  62.03 
 
 		 99 aa  98.6  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00269731  hitchhiker  0.00788498 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3156  Maf-like protein  49.41 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1864  putative solute symporter protein  58.75 
 
 		 87 aa  96.7  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0698534  normal  0.307528 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0524  hypothetical protein  51.19 
 
 		 92 aa  95.5  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2051  Maf-like protein  52.22 
 
 		 91 aa  94  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.342839 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0262  hypothetical protein  48.81 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0087  hypothetical protein  50.57 
 
 		 88 aa  91.3  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.161414 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002208  hypothetical protein  48.81 
 
 		 87 aa  90.9  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00159  hypothetical protein  48.81 
 
 		 105 aa  90.5  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2480  putative solute symporter protein  55.56 
 
 		 82 aa  90.1  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.029038 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1041  membrane protein  56.47 
 
 		 86 aa  89  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464753 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4953  hypothetical protein  48.05 
 
 		 83 aa  85.5  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1522  hypothetical protein  47.62 
 
 		 88 aa  85.5  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.21911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00720  hypothetical protein  48.19 
 
 		 88 aa  85.5  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1650  hypothetical protein  49.4 
 
 		 85 aa  82.8  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00520982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2827  hypothetical protein  46.43 
 
 		 113 aa  83.2  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1262  hypothetical protein  48.19 
 
 		 85 aa  82.4  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0702268  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2858  hypothetical protein  47.62 
 
 		 88 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3405  hypothetical protein  50.59 
 
 		 95 aa  81.6  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.760954  normal  0.315364 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1574  hypothetical protein  47.62 
 
 		 88 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000101201 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1580  hypothetical protein  47.62 
 
 		 88 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188511  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1513  hypothetical protein  47.62 
 
 		 88 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00712385 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2753  hypothetical protein  45.24 
 
 		 88 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070316 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1710  hypothetical protein  45.24 
 
 		 88 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000109022 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2674  hypothetical protein  45.24 
 
 		 88 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.476538  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2639  hypothetical protein  45.24 
 
 		 88 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1299  membrane protein  50.6 
 
 		 84 aa  80.1  0.000000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.863066 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1695  hypothetical protein  45.24 
 
 		 88 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.745801  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2359  hypothetical protein  45.24 
 
 		 88 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1176  hypothetical protein  45.78 
 
 		 84 aa  79.7  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1546  hypothetical protein  45.24 
 
 		 88 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.704875  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2277  hypothetical protein  46.43 
 
 		 88 aa  79.3  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0556  hypothetical protein  47.56 
 
 		 83 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0487  hypothetical protein  46.99 
 
 		 85 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0195334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2372  hypothetical protein  45.24 
 
 		 88 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.810646  hitchhiker  0.000114993 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1745  hypothetical protein  44.05 
 
 		 88 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.588903  hitchhiker  0.0000483214 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1770  hypothetical protein  47.19 
 
 		 91 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0986234  normal  0.427935 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4789  hypothetical protein  48.72 
 
 		 84 aa  77.4  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2839  hypothetical protein  44.05 
 
 		 88 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.82179  hitchhiker  0.0000856342 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4039  putative solute symporter protein  48.75 
 
 		 83 aa  75.1  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3833  membrane protein  51.28 
 
 		 86 aa  73.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.536523 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1793  hypothetical protein  46.99 
 
 		 85 aa  73.9  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000127525  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0631  hypothetical protein  42.68 
 
 		 83 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3755  hypothetical protein  44.58 
 
 		 85 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.55636  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3697  hypothetical protein  44.58 
 
 		 85 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3461  membrane protein-like protein  39.51 
 
 		 93 aa  71.2  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000680591  normal  0.123205 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2263  membrane protein-like protein  41.18 
 
 		 93 aa  70.1  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225575 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3838  hypothetical protein  43.37 
 
 		 85 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.313287  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1629  membrane protein-like protein  40 
 
 		 93 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.604047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5742  putative solute symporter protein  40.96 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1497  hypothetical protein  40.96 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.021579  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1524  membrane protein  36.47 
 
 		 85 aa  62  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.261907  normal  0.0715652 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3040  hypothetical protein  36.47 
 
 		 90 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0245  SSS sodium solute transporter superfamily  40.79 
 
 		 729 aa  57  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2397  hypothetical protein  32.94 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.928873 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3138  membrane protein-like protein  35.37 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1638  membrane protein  33.75 
 
 		 83 aa  55.1  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.317317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3112  hypothetical protein  39.19 
 
 		 131 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985689  decreased coverage  0.0000131927 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1417  membrane protein  36.84 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.1208 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0865  hypothetical protein  35.63 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0675484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4145  membrane protein-like  35.29 
 
 		 86 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257002  normal  0.0353718 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1265  hypothetical protein  34.12 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0463  hypothetical protein  32.1 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0351  Na+/solute symporter  36.14 
 
 		 759 aa  47.4  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.572111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5519  membrane protein-like  37.84 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.511237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2229  membrane protein-like protein  37.84 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2108  membrane protein-like protein  37.84 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2215  membrane protein-like protein  38.89 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5887  membrane protein-like  36.36 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2190  membrane protein-like protein  36.36 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2016  hypothetical protein  39.13 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.220495  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2051  membrane protein-like protein  41.51 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.708436  normal  0.400177 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0524  hypothetical protein  31.43 
 
 		 106 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270703  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1793  hypothetical protein  35.14 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.28026  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1023  membrane protein  30.23 
 
 		 87 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.451151  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0787  hypothetical protein  35.14 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0629  hypothetical protein  35.14 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.218405  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0531  hypothetical protein  35.14 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>