43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2086 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3164  replication protein A  47.61 
 
 		 767 aa  661    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2086  replication gene A  100 
 
 		 730 aa  1521    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1832  replication gene A protein  59.67 
 
 		 731 aa  853    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0199047  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0988  replication gene A protein  46.39 
 
 		 758 aa  619  1e-176  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.357702  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0874  replication gene A  45.82 
 
 		 687 aa  613  9.999999999999999e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0744565  normal  0.152153 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4357  replication gene A protein  46.84 
 
 		 707 aa  612  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.417362  hitchhiker  0.000000000116527 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3058  bacteriophage replication gene A protein  46.79 
 
 		 760 aa  614  9.999999999999999e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00583111  decreased coverage  0.000000000126727 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4315  replication gene A protein  45.79 
 
 		 761 aa  611  1e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.908807  hitchhiker  0.000153162 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0892  replication gene A  43.66 
 
 		 759 aa  579  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.427848  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3837  replication gene A  35.8 
 
 		 684 aa  327  4.0000000000000003e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.546581  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3505  bacteriophage replication gene A  34.6 
 
 		 740 aa  325  2e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.14007  normal  0.112396 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2941  replication gene A protein  35.64 
 
 		 673 aa  320  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  decreased coverage  2.3159e-27 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2322  replication gene A  31.27 
 
 		 851 aa  319  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0971146  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3496  replication gene A protein  35.47 
 
 		 673 aa  317  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  2.35531e-26 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2638  replication protein A  32.85 
 
 		 836 aa  292  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250136  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2663  bacteriophage replication gene A protein  33.02 
 
 		 940 aa  275  3e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.978524  hitchhiker  0.000159961 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0712  bacteriophage replication gene A  34.76 
 
 		 782 aa  260  7e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0364849 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1020  phage replication protein  29.23 
 
 		 837 aa  258  3e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0916  replication gene A protein  34.03 
 
 		 550 aa  252  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2784  replication gene A  27.4 
 
 		 790 aa  243  7e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0528107  hitchhiker  0.000414581 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0688  bacteriophage replication gene A  30.56 
 
 		 893 aa  241  5e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.754917  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0918  putative replication gene A protein  28.18 
 
 		 804 aa  240  5.999999999999999e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0157966  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3057  bacteriophage replication gene A  28.2 
 
 		 798 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.848842  normal  0.491579 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1350  bacteriophage replication gene A  29.3 
 
 		 803 aa  236  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0558946  normal  0.201886 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05016  hypothetical protein  30.07 
 
 		 628 aa  211  5e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0975  bacteriophage replication gene A  35.67 
 
 		 563 aa  204  4e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0831  bacteriophage replication gene A  35.67 
 
 		 563 aa  204  4e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1277  bacteriophage replication gene A  30.26 
 
 		 743 aa  204  6e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.280634  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2920  replication gene A  30.9 
 
 		 759 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.663672  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1066  hypothetical protein  28.07 
 
 		 849 aa  192  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2609  bacteriophage replication gene A  31.89 
 
 		 640 aa  189  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.875079  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2080  replication protein A  31.04 
 
 		 602 aa  186  9e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.292515  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2615  replication gene A  32.41 
 
 		 659 aa  184  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00951013  hitchhiker  0.00000000000132404 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2581  replication gene A  32.41 
 
 		 659 aa  184  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00609775  hitchhiker  0.000126543 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003288  putative replication protein  33.24 
 
 		 514 aa  183  9.000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.759025  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003461  hypothetical protein  31.06 
 
 		 676 aa  176  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1363  bacteriophage replication protein  29.55 
 
 		 597 aa  169  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.291469  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1837  bacteriophage replication protein  30.4 
 
 		 711 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00835  hypothetical protein  31.12 
 
 		 481 aa  151  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.40375  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00819  conserved hypothetical protein  31.12 
 
 		 481 aa  151  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.29421  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0739  putative phage replication protein  36.04 
 
 		 158 aa  63.2  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1099  radical SAM domain-containing protein  25.49 
 
 		 403 aa  45.4  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0020  bacteriophage replication gene A protein  25.49 
 
 		 403 aa  45.4  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>