41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0739 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0739  putative phage replication protein  100 
 
 		 158 aa  332  2e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0712  bacteriophage replication gene A  40.14 
 
 		 782 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0364849 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003461  hypothetical protein  39.45 
 
 		 676 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2609  bacteriophage replication gene A  40.38 
 
 		 640 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.875079  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0874  replication gene A  41.58 
 
 		 687 aa  71.2  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0744565  normal  0.152153 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2638  replication protein A  50.65 
 
 		 836 aa  70.9  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250136  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2322  replication gene A  50 
 
 		 851 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0971146  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1277  bacteriophage replication gene A  38.76 
 
 		 743 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.280634  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2920  replication gene A  37.98 
 
 		 759 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.663672  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003288  putative replication protein  40.62 
 
 		 514 aa  67.4  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.759025  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3496  replication gene A protein  34.75 
 
 		 673 aa  67.4  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  2.35531e-26 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2941  replication gene A protein  34.75 
 
 		 673 aa  67  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  decreased coverage  2.3159e-27 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3505  bacteriophage replication gene A  33.09 
 
 		 740 aa  66.2  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.14007  normal  0.112396 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0688  bacteriophage replication gene A  32.58 
 
 		 893 aa  62.4  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.754917  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1837  bacteriophage replication protein  45.45 
 
 		 711 aa  60.8  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1350  bacteriophage replication gene A  44 
 
 		 803 aa  59.7  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0558946  normal  0.201886 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1363  bacteriophage replication protein  37.04 
 
 		 597 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.291469  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2080  replication protein A  38.14 
 
 		 602 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.292515  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2784  replication gene A  44 
 
 		 790 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0528107  hitchhiker  0.000414581 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0918  putative replication gene A protein  44 
 
 		 804 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0157966  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3164  replication protein A  31.69 
 
 		 767 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00819  conserved hypothetical protein  44 
 
 		 481 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.29421  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00835  hypothetical protein  44 
 
 		 481 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.40375  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3837  replication gene A  44.59 
 
 		 684 aa  58.5  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.546581  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0831  bacteriophage replication gene A  41.43 
 
 		 563 aa  57.4  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0975  bacteriophage replication gene A  41.43 
 
 		 563 aa  57.4  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1832  replication gene A protein  28.99 
 
 		 731 aa  57.4  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0199047  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4357  replication gene A protein  45.71 
 
 		 707 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.417362  hitchhiker  0.000000000116527 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3057  bacteriophage replication gene A  42.67 
 
 		 798 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.848842  normal  0.491579 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3058  bacteriophage replication gene A protein  45.71 
 
 		 760 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00583111  decreased coverage  0.000000000126727 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2663  bacteriophage replication gene A protein  35.29 
 
 		 940 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.978524  hitchhiker  0.000159961 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0988  replication gene A protein  45.71 
 
 		 758 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.357702  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4315  replication gene A protein  45.71 
 
 		 761 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.908807  hitchhiker  0.000153162 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0892  replication gene A  32.61 
 
 		 759 aa  55.1  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.427848  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05016  hypothetical protein  41.57 
 
 		 628 aa  53.9  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2615  replication gene A  32.65 
 
 		 659 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00951013  hitchhiker  0.00000000000132404 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2581  replication gene A  32.65 
 
 		 659 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00609775  hitchhiker  0.000126543 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2086  replication gene A  33.33 
 
 		 730 aa  52.4  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1066  hypothetical protein  43.24 
 
 		 849 aa  52  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1020  phage replication protein  38.75 
 
 		 837 aa  49.3  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0916  replication gene A protein  32.71 
 
 		 550 aa  47.8  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>