41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1363 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II1363  bacteriophage replication protein  100 
 
 
597 aa  1222    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.291469  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0831  bacteriophage replication gene A  41.73 
 
 
563 aa  294  2e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0975  bacteriophage replication gene A  41.73 
 
 
563 aa  294  2e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1837  bacteriophage replication protein  35.68 
 
 
711 aa  280  7e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2615  replication gene A  43.56 
 
 
659 aa  276  6e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00951013  hitchhiker  0.00000000000132404 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2581  replication gene A  43.56 
 
 
659 aa  276  6e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00609775  hitchhiker  0.000126543 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003288  putative replication protein  41.6 
 
 
514 aa  261  3e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.759025  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2609  bacteriophage replication gene A  38.22 
 
 
640 aa  238  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.875079  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0712  bacteriophage replication gene A  34.45 
 
 
782 aa  232  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0364849 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3496  replication gene A protein  34.48 
 
 
673 aa  230  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  decreased coverage  2.35531e-26 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2941  replication gene A protein  34.25 
 
 
673 aa  227  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  decreased coverage  2.3159e-27 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003461  hypothetical protein  37.84 
 
 
676 aa  226  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3837  replication gene A  34.36 
 
 
684 aa  226  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.546581  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3505  bacteriophage replication gene A  37.16 
 
 
740 aa  220  6e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.14007  normal  0.112396 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0688  bacteriophage replication gene A  31.55 
 
 
893 aa  217  5e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.754917  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1277  bacteriophage replication gene A  35.75 
 
 
743 aa  207  6e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.280634  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2920  replication gene A  36.81 
 
 
759 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.663672  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05016  hypothetical protein  31.26 
 
 
628 aa  199  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1066  hypothetical protein  34.42 
 
 
849 aa  197  4.0000000000000005e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1020  phage replication protein  30.8 
 
 
837 aa  197  5.000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0874  replication gene A  31.05 
 
 
687 aa  192  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0744565  normal  0.152153 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2638  replication protein A  31.02 
 
 
836 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250136  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2322  replication gene A  36.66 
 
 
851 aa  188  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0971146  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3164  replication protein A  31.9 
 
 
767 aa  188  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4357  replication gene A protein  31.73 
 
 
707 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.417362  hitchhiker  0.000000000116527 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1350  bacteriophage replication gene A  30.47 
 
 
803 aa  185  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0558946  normal  0.201886 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2784  replication gene A  30.25 
 
 
790 aa  183  8.000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0528107  hitchhiker  0.000414581 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0918  putative replication gene A protein  30.25 
 
 
804 aa  182  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0157966  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3057  bacteriophage replication gene A  29.8 
 
 
798 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.848842  normal  0.491579 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2663  bacteriophage replication gene A protein  30 
 
 
940 aa  179  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.978524  hitchhiker  0.000159961 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3058  bacteriophage replication gene A protein  35.44 
 
 
760 aa  179  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00583111  decreased coverage  0.000000000126727 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4315  replication gene A protein  35.44 
 
 
761 aa  178  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.908807  hitchhiker  0.000153162 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0988  replication gene A protein  35.44 
 
 
758 aa  177  5e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.357702  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0892  replication gene A  30.72 
 
 
759 aa  176  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.427848  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1832  replication gene A protein  31.71 
 
 
731 aa  160  6e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0199047  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2086  replication gene A  29.4 
 
 
730 aa  158  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2080  replication protein A  32 
 
 
602 aa  156  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.292515  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0916  replication gene A protein  28.04 
 
 
550 aa  141  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00835  hypothetical protein  29.78 
 
 
481 aa  97.4  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.40375  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00819  conserved hypothetical protein  29.78 
 
 
481 aa  97.4  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.29421  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0739  putative phage replication protein  37.04 
 
 
158 aa  59.7  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>