24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5605 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5605  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  663    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748883 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0702  hypothetical protein  63.76 
 
 		 298 aa  372  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0635237 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0680  hypothetical protein  64.21 
 
 		 285 aa  372  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0977  hypothetical protein  64.86 
 
 		 288 aa  363  3e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.32556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3720  hypothetical protein  59.14 
 
 		 293 aa  333  2e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000274124  normal  0.0114353 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6282  hypothetical protein  58.42 
 
 		 287 aa  322  8e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000883359  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2359  hypothetical protein  45.83 
 
 		 290 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.367222  normal  0.303498 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5614  hypothetical protein  38.08 
 
 		 261 aa  179  7e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.987528 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49545  predicted protein  37.5 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3863  hypothetical protein  37.64 
 
 		 264 aa  175  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.725536 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0304  hypothetical protein  33.45 
 
 		 345 aa  127  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0347012  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2254  hypothetical protein  30.72 
 
 		 345 aa  117  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.108398  normal  0.210374 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2210  hypothetical protein  32.57 
 
 		 348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.22069 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2694  hypothetical protein  33.46 
 
 		 353 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1629  nicotinamidase  26.59 
 
 		 300 aa  109  7.000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000375318  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2409  hypothetical protein  31.72 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000136883  hitchhiker  0.00000184258 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1379  nicotinamidase  22.81 
 
 		 298 aa  90.9  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10680  nicotinamidase-like amidase  29.96 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107249  normal  0.953023 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06120  nicotinamidase-like amidase  28.04 
 
 		 199 aa  45.8  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0678  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  25.61 
 
 		 170 aa  44.7  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0274495 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2374  isochorismatase hydrolase  26.23 
 
 		 199 aa  44.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188598  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3295  pyrazinamidase/nicotinamidase  28.96 
 
 		 216 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.20048  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3125  nicotinamidase  29.6 
 
 		 214 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0352005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0014  nicotinamidase  27.91 
 
 		 197 aa  42.7  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.970304 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>