18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2409 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2409  hypothetical protein  100 
 
 
340 aa  705    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000136883  hitchhiker  0.00000184258 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0304  hypothetical protein  78.92 
 
 
345 aa  566  1e-160  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0347012  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2210  hypothetical protein  69.44 
 
 
348 aa  512  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.22069 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2694  hypothetical protein  67.07 
 
 
353 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2254  hypothetical protein  45.91 
 
 
345 aa  299  5e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.108398  normal  0.210374 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49545  predicted protein  32.46 
 
 
300 aa  134  3e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2359  hypothetical protein  31.79 
 
 
290 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.367222  normal  0.303498 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5614  hypothetical protein  30.9 
 
 
261 aa  119  7.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.987528 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3863  hypothetical protein  32.53 
 
 
264 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.725536 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5605  hypothetical protein  32.41 
 
 
324 aa  114  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.748883 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3720  hypothetical protein  31.68 
 
 
293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000274124  normal  0.0114353 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6282  hypothetical protein  31.44 
 
 
287 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000883359  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1629  nicotinamidase  28 
 
 
300 aa  105  8e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000375318  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0702  hypothetical protein  29.49 
 
 
298 aa  103  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0635237 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0680  hypothetical protein  29.49 
 
 
285 aa  104  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0977  hypothetical protein  28 
 
 
288 aa  100  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.32556  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1379  nicotinamidase  27.5 
 
 
298 aa  89.4  8e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2845  pyrazinamidase/nicotinamidase  25 
 
 
208 aa  43.1  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>