72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49545 on replicon NC_011690
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011690  PHATRDRAFT_49545  predicted protein  100 
 
 
300 aa  628  1e-179  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5605  hypothetical protein  37.5 
 
 
324 aa  177  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.748883 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5614  hypothetical protein  34.93 
 
 
261 aa  176  6e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.987528 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3863  hypothetical protein  34.81 
 
 
264 aa  175  8e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.725536 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2359  hypothetical protein  33.97 
 
 
290 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.367222  normal  0.303498 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3720  hypothetical protein  33.12 
 
 
293 aa  161  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000274124  normal  0.0114353 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0680  hypothetical protein  33.44 
 
 
285 aa  160  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0702  hypothetical protein  33.44 
 
 
298 aa  159  4e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0635237 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6282  hypothetical protein  34.87 
 
 
287 aa  159  8e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000883359  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0977  hypothetical protein  32.25 
 
 
288 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.32556  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2210  hypothetical protein  31.8 
 
 
348 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.22069 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2694  hypothetical protein  33.98 
 
 
353 aa  136  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2254  hypothetical protein  33.33 
 
 
345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.108398  normal  0.210374 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0304  hypothetical protein  31.07 
 
 
345 aa  134  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0347012  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2409  hypothetical protein  32.79 
 
 
340 aa  130  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000136883  hitchhiker  0.00000184258 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1629  nicotinamidase  24.48 
 
 
300 aa  101  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000375318  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1379  nicotinamidase  23.53 
 
 
298 aa  86.3  6e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2683  bifunctional pyrazinamidase/nicotinamidase  24.03 
 
 
213 aa  53.1  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.552581  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10680  nicotinamidase-like amidase  47.27 
 
 
211 aa  52  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107249  normal  0.953023 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06120  nicotinamidase-like amidase  46 
 
 
199 aa  50.1  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0906  isochorismatase family protein  47.46 
 
 
89 aa  49.3  0.00007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0345  nicotinamidase/ pyrazinamidase  45.76 
 
 
206 aa  49.3  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5206  nicotinamidase  38.1 
 
 
210 aa  49.3  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.704992  normal  0.539889 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1823  nicotinamidase  38.1 
 
 
210 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.604987  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1760  bifunctional pyrazinamidase/nicotinamidase hydrolase  43.64 
 
 
210 aa  48.9  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130919  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1893  nicotinamidase  39.29 
 
 
210 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1211  nicotinamidase  39.34 
 
 
206 aa  48.1  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0305346 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4376  Nicotinamidase  36.76 
 
 
208 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.540269 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1010  nicotinamidase  45.76 
 
 
204 aa  47.8  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.4989  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4273  Nicotinamidase  36.76 
 
 
208 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00705625  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1928  nicotinamidase  36.51 
 
 
210 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528712  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3430  nicotinamidase  41.38 
 
 
201 aa  47  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.498347  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1905  nicotinamidase  38.1 
 
 
210 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1519  isochorismatase hydrolase  39.51 
 
 
189 aa  46.6  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226465  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6174  nicotinamidase  36.51 
 
 
210 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1369  nicotinamidase  37.1 
 
 
210 aa  46.2  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0678312  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1096  isochorismatase hydrolase  44.9 
 
 
193 aa  45.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.843144  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0323  nicotinamidase/ pyrazinamidase  44.07 
 
 
206 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2319  isochorismatase hydrolase  46 
 
 
207 aa  45.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115506 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5494  isochorismatase hydrolase  37.04 
 
 
184 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247983  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07780  nicotinamidase, putative  44.29 
 
 
225 aa  44.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  44.23 
 
 
201 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3877  isochorismatase hydrolase  44 
 
 
192 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.673276  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5114  isochorismatase hydrolase  37.04 
 
 
184 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5203  isochorismatase hydrolase  37.04 
 
 
184 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2887  nicotinamidase  40 
 
 
208 aa  43.9  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2143  pyrazinamidase/nicotinamidase  39.29 
 
 
212 aa  44.3  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.492311  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1854  isochorismatase hydrolase  38.18 
 
 
221 aa  44.3  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130267  normal  0.175383 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1348  isochorismatase hydrolase  43.94 
 
 
199 aa  43.9  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000252341 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1029  nicotinamidase  38.98 
 
 
208 aa  43.5  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289397  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3295  pyrazinamidase/nicotinamidase  38.1 
 
 
216 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.20048  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3904  nicotinamidase  37.1 
 
 
225 aa  43.5  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250858  normal  0.303897 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1487  Nicotinamidase  38.46 
 
 
213 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0102489  normal  0.0234233 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1406  nicotinamidase  41.82 
 
 
212 aa  43.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0958  isochorismatase hydrolase  44.9 
 
 
194 aa  43.5  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0651  pyrazinamidase/nicotinamidase  40.68 
 
 
206 aa  43.5  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.972154  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3002  nicotinamidase  23.21 
 
 
201 aa  43.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.574264  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1744  nicotinamidase  41.67 
 
 
216 aa  42.7  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0960  isochorismatase family protein  40.68 
 
 
202 aa  43.1  0.006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.382034  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2454  pyrazinamidase/nicotinamidase  37.5 
 
 
212 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1200  pyrazinamidase/nicotinamidase  37.5 
 
 
212 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.694975  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1927  pyrazinamidase/nicotinamidase  37.5 
 
 
212 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1437  pyrazinamidase/nicotinamidase  37.5 
 
 
212 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00306349  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3377  pyrazinamidase/nicotinamidase  37.5 
 
 
212 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2293  pyrazinamidase/nicotinamidase  37.5 
 
 
212 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2332  pyrazinamidase/nicotinamidase  37.5 
 
 
212 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.298294  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1446  Nicotinamidase  37.1 
 
 
213 aa  42.7  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.471389  normal  0.0104691 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1351  isochorismatase hydrolase  39.02 
 
 
191 aa  42.4  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3207  isochorismatase hydrolase  33.9 
 
 
203 aa  42.4  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126521  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0678  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  28.72 
 
 
170 aa  42.4  0.009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0274495 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  33.71 
 
 
201 aa  42.4  0.01  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0189  putative pyrazinamidase/nicotinamidase  35 
 
 
237 aa  42.4  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>