22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3720 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_3720  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  598  1e-170  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000274124  normal  0.0114353 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6282  hypothetical protein  72.13 
 
 
287 aa  428  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000883359  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0702  hypothetical protein  61.05 
 
 
298 aa  358  8e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0635237 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0680  hypothetical protein  61.13 
 
 
285 aa  356  1.9999999999999998e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0977  hypothetical protein  60.87 
 
 
288 aa  348  5e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.32556  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5605  hypothetical protein  59.14 
 
 
324 aa  333  1e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.748883 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2359  hypothetical protein  46.37 
 
 
290 aa  235  7e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.367222  normal  0.303498 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5614  hypothetical protein  37.45 
 
 
261 aa  171  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.987528 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3863  hypothetical protein  36.33 
 
 
264 aa  171  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.725536 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49545  predicted protein  33.12 
 
 
300 aa  161  1e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1629  nicotinamidase  27.44 
 
 
300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000375318  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2210  hypothetical protein  34.83 
 
 
348 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.22069 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2694  hypothetical protein  31.65 
 
 
353 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0304  hypothetical protein  31.09 
 
 
345 aa  117  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0347012  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2254  hypothetical protein  32.01 
 
 
345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.108398  normal  0.210374 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2409  hypothetical protein  31.02 
 
 
340 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000136883  hitchhiker  0.00000184258 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1379  nicotinamidase  24.63 
 
 
298 aa  94.7  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2254  isochorismatase hydrolase  31.03 
 
 
210 aa  47.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1963  isochorismatase hydrolase  31.33 
 
 
210 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0190447  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10680  nicotinamidase-like amidase  33.33 
 
 
211 aa  47  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107249  normal  0.953023 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2845  pyrazinamidase/nicotinamidase  29.05 
 
 
208 aa  45.8  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2374  isochorismatase hydrolase  32.79 
 
 
199 aa  44.3  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188598  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>