18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0977 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0977  hypothetical protein  100 
 
 
288 aa  581  1.0000000000000001e-165  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.32556  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0702  hypothetical protein  71.22 
 
 
298 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0635237 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0680  hypothetical protein  71.22 
 
 
285 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5605  hypothetical protein  64.86 
 
 
324 aa  363  2e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.748883 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6282  hypothetical protein  64.84 
 
 
287 aa  360  2e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000883359  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3720  hypothetical protein  60.87 
 
 
293 aa  348  5e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000274124  normal  0.0114353 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2359  hypothetical protein  43.2 
 
 
290 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.367222  normal  0.303498 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3863  hypothetical protein  36.16 
 
 
264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.725536 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5614  hypothetical protein  34.55 
 
 
261 aa  162  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.987528 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49545  predicted protein  32.25 
 
 
300 aa  146  3e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1629  nicotinamidase  24.29 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000375318  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2254  hypothetical protein  30.88 
 
 
345 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.108398  normal  0.210374 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0304  hypothetical protein  29.55 
 
 
345 aa  106  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0347012  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2694  hypothetical protein  29.66 
 
 
353 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2210  hypothetical protein  28.42 
 
 
348 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.22069 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1379  nicotinamidase  21.77 
 
 
298 aa  96.7  4e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2409  hypothetical protein  28.96 
 
 
340 aa  95.1  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000136883  hitchhiker  0.00000184258 
 
 
-
 
NC_002950  PG0678  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  25.22 
 
 
170 aa  46.6  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0274495 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>