17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2359 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2359  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  589  1e-167  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.367222  normal  0.303498 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6282  hypothetical protein  47.72 
 
 		 287 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000883359  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5605  hypothetical protein  45.83 
 
 		 324 aa  239  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748883 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3720  hypothetical protein  46.37 
 
 		 293 aa  235  7e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000274124  normal  0.0114353 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0680  hypothetical protein  46.37 
 
 		 285 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0702  hypothetical protein  46.37 
 
 		 298 aa  232  5e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0635237 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0977  hypothetical protein  43.2 
 
 		 288 aa  217  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.32556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3863  hypothetical protein  41.11 
 
 		 264 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.725536 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49545  predicted protein  33.97 
 
 		 300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5614  hypothetical protein  38.34 
 
 		 261 aa  173  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.987528 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2210  hypothetical protein  34.89 
 
 		 348 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.22069 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1629  nicotinamidase  32.14 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000375318  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2254  hypothetical protein  31.97 
 
 		 345 aa  132  9e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.108398  normal  0.210374 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0304  hypothetical protein  31.25 
 
 		 345 aa  130  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0347012  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2694  hypothetical protein  29.1 
 
 		 353 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1379  nicotinamidase  27.41 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2409  hypothetical protein  31.7 
 
 		 340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000136883  hitchhiker  0.00000184258 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>