More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2513 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2513  guanine deaminase  100 
 
 		 475 aa  968    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.713294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5414  chlorohydrolase family protein  51.67 
 
 		 463 aa  453  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3243  guanine deaminase  43.05 
 
 		 454 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_1769  predicted protein  38.69 
 
 		 395 aa  242  1e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0487247  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10903  chlorohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_4G03770)  35.35 
 
 		 538 aa  228  2e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0361662 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00990  hydrolase, putative  33.56 
 
 		 469 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.164651  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06815  guanine deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10210)  33.77 
 
 		 448 aa  215  9.999999999999999e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.373895 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0591  Guanine deaminase  30.08 
 
 		 427 aa  199  7e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36448  guanine deaminase (Guanase) (Guanine aminase) (Guanine aminohydrolase) (GAH)  29.31 
 
 		 501 aa  193  5e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0130969 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1794  guanine deaminase  31.82 
 
 		 434 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.868706  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3663  guanine aminohydrolase  31.06 
 
 		 437 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4281  guanine deaminase  31.42 
 
 		 434 aa  166  9e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01787  hypothetical protein  27.56 
 
 		 466 aa  164  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3845  guanine deaminase  31.19 
 
 		 434 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397164 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1587  guanine deaminase  31.19 
 
 		 434 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1812  guanine deaminase  30.56 
 
 		 444 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00974317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2377  guanine deaminase  32.93 
 
 		 439 aa  159  7e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.796063  normal  0.732304 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22260  guanine deaminase  32.39 
 
 		 432 aa  158  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.119985  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1610  guanine deaminase  31.37 
 
 		 437 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3607  guanine deaminase  29.57 
 
 		 434 aa  156  9e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0210  guanine deaminase  32.37 
 
 		 432 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.20137  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1677  guanine deaminase  28.5 
 
 		 433 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44770  guanine deaminase  30.14 
 
 		 434 aa  154  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.828703  normal  0.188746 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2754  guanine deaminase  32.1 
 
 		 433 aa  152  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.481519 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3812  guanine deaminase  30.14 
 
 		 434 aa  152  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.203808  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3717  guanine deaminase  29.02 
 
 		 429 aa  151  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3023  guanine deaminase  31.37 
 
 		 436 aa  150  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0463  guanine deaminase  31.37 
 
 		 436 aa  149  8e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.451458  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2609  guanine deaminase  31.37 
 
 		 436 aa  149  8e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.694405  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2918  guanine deaminase  31.37 
 
 		 436 aa  149  8e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.495945  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2978  guanine deaminase  31.37 
 
 		 436 aa  149  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528772  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0166  guanine deaminase  31.37 
 
 		 436 aa  149  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.301231  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0981  guanine deaminase  31.37 
 
 		 436 aa  149  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01660  guanine deaminase  32.75 
 
 		 456 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000118805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0539  guanine deaminase  31.09 
 
 		 439 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1018  guanine deaminase  31.09 
 
 		 439 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0977  guanine deaminase  30.85 
 
 		 439 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0414452 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3045  guanine deaminase  29.57 
 
 		 457 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.206823  normal  0.141945 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0893  guanine deaminase  31.19 
 
 		 438 aa  147  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0756096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4129  guanine deaminase  30.79 
 
 		 438 aa  146  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2684  guanine deaminase  28.12 
 
 		 441 aa  147  6e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.573349 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02716  guanine deaminase  27.05 
 
 		 439 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712282  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4173  guanine deaminase  27.27 
 
 		 438 aa  145  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3209  guanine deaminase  27.27 
 
 		 438 aa  145  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0881  guanine deaminase  31.19 
 
 		 438 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.821524  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0825  guanine deaminase  27.27 
 
 		 438 aa  145  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02678  hypothetical protein  27.05 
 
 		 439 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.600174  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3016  guanine deaminase  27.37 
 
 		 438 aa  145  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1496  guanine deaminase  30.38 
 
 		 449 aa  145  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0946  guanine deaminase  29.29 
 
 		 451 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334638  normal  0.424226 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3043  guanine deaminase  27.05 
 
 		 438 aa  144  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0809  guanine deaminase  27.05 
 
 		 438 aa  144  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1727  guanine deaminase  30.86 
 
 		 452 aa  144  5e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.434119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2046  guanine deaminase  30.44 
 
 		 452 aa  143  6e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177828  normal  0.651599 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2099  guanine deaminase  33.13 
 
 		 445 aa  141  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.716358 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0709  guanine deaminase  30.45 
 
 		 441 aa  141  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3881  guanine deaminase  30.77 
 
 		 428 aa  140  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3458  guanine deaminase  31.72 
 
 		 434 aa  140  4.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.164027 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02520  guanine deaminase  27.78 
 
 		 435 aa  140  7e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1087  guanine deaminase  30.9 
 
 		 457 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0146521 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2606  guanine deaminase  31.35 
 
 		 444 aa  139  7.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0889  guanine deaminase  33.33 
 
 		 446 aa  139  8.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.159977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3192  guanine deaminase  31.45 
 
 		 449 aa  139  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.673626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2429  guanine deaminase  26.2 
 
 		 431 aa  139  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3295  guanine deaminase  31.9 
 
 		 445 aa  138  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.403629  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1795  guanine deaminase  30.59 
 
 		 432 aa  138  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.319049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1926  guanine deaminase  32.33 
 
 		 444 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0907648  normal  0.0757179 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1049  guanine deaminase  32.19 
 
 		 427 aa  137  5e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1047  guanine deaminase  31.05 
 
 		 430 aa  136  7.000000000000001e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.134811  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2250  guanine deaminase  32.02 
 
 		 444 aa  136  8e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5972  guanine deaminase  30.34 
 
 		 419 aa  136  9e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.747945 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1129  guanine deaminase  31.91 
 
 		 427 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.387393  normal  0.517294 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1143  guanine deaminase  30.25 
 
 		 428 aa  133  5e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.14597  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4872  guanine deaminase  29.31 
 
 		 449 aa  132  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.673098  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1468  guanine deaminase  25.38 
 
 		 405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00567224  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2429  guanine deaminase  33.81 
 
 		 440 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.935428  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2299  guanine deaminase  27.67 
 
 		 443 aa  131  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1896  guanine deaminase  32.13 
 
 		 433 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1336  guanine deaminase  33.94 
 
 		 432 aa  130  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.117257  hitchhiker  0.000886879 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1336  guanine deaminase  33.88 
 
 		 435 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.521939  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1786  guanine deaminase  29.31 
 
 		 453 aa  129  9.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0256  guanine deaminase  30.93 
 
 		 439 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1148  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.69 
 
 		 445 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.356182 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1807  guanine deaminase  27.9 
 
 		 446 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000553099  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0801  guanine deaminase  32.96 
 
 		 445 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4260  guanine deaminase  32.85 
 
 		 425 aa  127  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.910106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0545  guanine deaminase  32.13 
 
 		 428 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3326  guanine deaminase  29.92 
 
 		 435 aa  126  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1148  amidohydrolase  30.65 
 
 		 486 aa  126  9e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.318929  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2870  guanine deaminase  29.89 
 
 		 435 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.153116 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2147  guanine deaminase  32.75 
 
 		 454 aa  125  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0293  guanine deaminase  32.41 
 
 		 426 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3129  amidohydrolase  33.45 
 
 		 434 aa  123  8e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.611034  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1905  guanine deaminase  31.11 
 
 		 429 aa  123  8e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1224  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.29 
 
 		 441 aa  122  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2724  guanine deaminase  31.01 
 
 		 425 aa  120  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3142  guanine deaminase  28.95 
 
 		 436 aa  120  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.14624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1462  guanine deaminase  30.63 
 
 		 430 aa  119  9e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0429597  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0081  amidohydrolase  28.78 
 
 		 513 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5279  amidohydrolase  30.92 
 
 		 447 aa  118  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.659974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>